Protein–RNA interactions for Protein: P0DPA3

SNHG28, Putative uncharacterized protein SNHG28, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG28P0DPA3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNHG28P0DPA3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNHG28P0DPA3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNHG28P0DPA3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SNHG28P0DPA3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNHG28P0DPA3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SNHG28P0DPA3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SNHG28P0DPA3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SNHG28P0DPA3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SNHG28P0DPA3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SNHG28P0DPA3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNHG28P0DPA3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNHG28P0DPA3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNHG28P0DPA3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNHG28P0DPA3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNHG28P0DPA3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNHG28P0DPA3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNHG28P0DPA3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SNHG28P0DPA3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SNHG28P0DPA3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SNHG28P0DPA3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SNHG28P0DPA3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SNHG28P0DPA3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SNHG28P0DPA3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SNHG28P0DPA3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SNHG28P0DPA3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SNHG28P0DPA3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SNHG28P0DPA3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SNHG28P0DPA3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SNHG28P0DPA3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNHG28P0DPA3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNHG28P0DPA3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNHG28P0DPA3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNHG28P0DPA3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNHG28P0DPA3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNHG28P0DPA3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNHG28P0DPA3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNHG28P0DPA3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNHG28P0DPA3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNHG28P0DPA3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SNHG28P0DPA3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SNHG28P0DPA3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNHG28P0DPA3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNHG28P0DPA3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNHG28P0DPA3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNHG28P0DPA3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SNHG28P0DPA3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SNHG28P0DPA3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SNHG28P0DPA3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SNHG28P0DPA3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SNHG28P0DPA3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SNHG28P0DPA3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SNHG28P0DPA3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SNHG28P0DPA3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SNHG28P0DPA3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SNHG28P0DPA3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SNHG28P0DPA3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SNHG28P0DPA3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SNHG28P0DPA3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SNHG28P0DPA3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SNHG28P0DPA3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SNHG28P0DPA3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SNHG28P0DPA3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SNHG28P0DPA3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SNHG28P0DPA3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SNHG28P0DPA3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SNHG28P0DPA3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SNHG28P0DPA3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SNHG28P0DPA3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SNHG28P0DPA3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SNHG28P0DPA3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SNHG28P0DPA3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SNHG28P0DPA3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SNHG28P0DPA3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNHG28P0DPA3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SNHG28P0DPA3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNHG28P0DPA3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNHG28P0DPA3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SNHG28P0DPA3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNHG28P0DPA3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNHG28P0DPA3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNHG28P0DPA3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNHG28P0DPA3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNHG28P0DPA3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNHG28P0DPA3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SNHG28P0DPA3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNHG28P0DPA3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNHG28P0DPA3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SNHG28P0DPA3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNHG28P0DPA3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNHG28P0DPA3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNHG28P0DPA3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNHG28P0DPA3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNHG28P0DPA3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNHG28P0DPA3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNHG28P0DPA3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
SNHG28P0DPA3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNHG28P0DPA3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SNHG28P0DPA3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNHG28P0DPA3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms