Protein–RNA interactions for Protein: P0DN79

CBSL, Cystathionine beta-synthase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSLP0DN79 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CBSLP0DN79 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CBSLP0DN79 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CBSLP0DN79 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CBSLP0DN79 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CBSLP0DN79 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CBSLP0DN79 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CBSLP0DN79 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CBSLP0DN79 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CBSLP0DN79 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBSLP0DN79 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBSLP0DN79 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CBSLP0DN79 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBSLP0DN79 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBSLP0DN79 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBSLP0DN79 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBSLP0DN79 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBSLP0DN79 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBSLP0DN79 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBSLP0DN79 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBSLP0DN79 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBSLP0DN79 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBSLP0DN79 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBSLP0DN79 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CBSLP0DN79 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBSLP0DN79 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBSLP0DN79 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBSLP0DN79 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBSLP0DN79 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBSLP0DN79 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBSLP0DN79 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBSLP0DN79 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBSLP0DN79 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBSLP0DN79 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBSLP0DN79 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBSLP0DN79 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBSLP0DN79 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CBSLP0DN79 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBSLP0DN79 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBSLP0DN79 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CBSLP0DN79 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CBSLP0DN79 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CBSLP0DN79 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CBSLP0DN79 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBSLP0DN79 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBSLP0DN79 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBSLP0DN79 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBSLP0DN79 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBSLP0DN79 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBSLP0DN79 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBSLP0DN79 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBSLP0DN79 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBSLP0DN79 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBSLP0DN79 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBSLP0DN79 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBSLP0DN79 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBSLP0DN79 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBSLP0DN79 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBSLP0DN79 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBSLP0DN79 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBSLP0DN79 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBSLP0DN79 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBSLP0DN79 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBSLP0DN79 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBSLP0DN79 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBSLP0DN79 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBSLP0DN79 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBSLP0DN79 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBSLP0DN79 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBSLP0DN79 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBSLP0DN79 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBSLP0DN79 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBSLP0DN79 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBSLP0DN79 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBSLP0DN79 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBSLP0DN79 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBSLP0DN79 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBSLP0DN79 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBSLP0DN79 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBSLP0DN79 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBSLP0DN79 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBSLP0DN79 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBSLP0DN79 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBSLP0DN79 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBSLP0DN79 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBSLP0DN79 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBSLP0DN79 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBSLP0DN79 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CBSLP0DN79 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CBSLP0DN79 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CBSLP0DN79 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CBSLP0DN79 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBSLP0DN79 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBSLP0DN79 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CBSLP0DN79 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBSLP0DN79 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBSLP0DN79 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBSLP0DN79 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBSLP0DN79 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBSLP0DN79 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.4 ms