Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
C8orf88P0DMB2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C8orf88P0DMB2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C8orf88P0DMB2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C8orf88P0DMB2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C8orf88P0DMB2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C8orf88P0DMB2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C8orf88P0DMB2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C8orf88P0DMB2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
C8orf88P0DMB2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C8orf88P0DMB2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C8orf88P0DMB2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C8orf88P0DMB2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C8orf88P0DMB2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C8orf88P0DMB2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
C8orf88P0DMB2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C8orf88P0DMB2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C8orf88P0DMB2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C8orf88P0DMB2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C8orf88P0DMB2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C8orf88P0DMB2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C8orf88P0DMB2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C8orf88P0DMB2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C8orf88P0DMB2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C8orf88P0DMB2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C8orf88P0DMB2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C8orf88P0DMB2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C8orf88P0DMB2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C8orf88P0DMB2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C8orf88P0DMB2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C8orf88P0DMB2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C8orf88P0DMB2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C8orf88P0DMB2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C8orf88P0DMB2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C8orf88P0DMB2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C8orf88P0DMB2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C8orf88P0DMB2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C8orf88P0DMB2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C8orf88P0DMB2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C8orf88P0DMB2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
C8orf88P0DMB2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C8orf88P0DMB2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C8orf88P0DMB2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C8orf88P0DMB2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C8orf88P0DMB2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C8orf88P0DMB2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C8orf88P0DMB2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
C8orf88P0DMB2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.55
C8orf88P0DMB2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C8orf88P0DMB2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C8orf88P0DMB2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C8orf88P0DMB2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C8orf88P0DMB2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C8orf88P0DMB2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C8orf88P0DMB2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C8orf88P0DMB2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C8orf88P0DMB2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C8orf88P0DMB2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C8orf88P0DMB2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C8orf88P0DMB2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C8orf88P0DMB2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C8orf88P0DMB2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C8orf88P0DMB2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C8orf88P0DMB2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C8orf88P0DMB2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C8orf88P0DMB2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C8orf88P0DMB2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C8orf88P0DMB2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C8orf88P0DMB2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C8orf88P0DMB2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C8orf88P0DMB2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C8orf88P0DMB2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C8orf88P0DMB2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C8orf88P0DMB2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C8orf88P0DMB2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C8orf88P0DMB2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C8orf88P0DMB2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C8orf88P0DMB2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C8orf88P0DMB2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C8orf88P0DMB2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
C8orf88P0DMB2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C8orf88P0DMB2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C8orf88P0DMB2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C8orf88P0DMB2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C8orf88P0DMB2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C8orf88P0DMB2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C8orf88P0DMB2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C8orf88P0DMB2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C8orf88P0DMB2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C8orf88P0DMB2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C8orf88P0DMB2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
C8orf88P0DMB2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C8orf88P0DMB2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C8orf88P0DMB2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C8orf88P0DMB2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C8orf88P0DMB2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C8orf88P0DMB2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C8orf88P0DMB2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C8orf88P0DMB2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C8orf88P0DMB2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms