Protein–RNA interactions for Protein: P0DJ93

SMIM13, Small integral membrane protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM13P0DJ93 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM13P0DJ93 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM13P0DJ93 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM13P0DJ93 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM13P0DJ93 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM13P0DJ93 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM13P0DJ93 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM13P0DJ93 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM13P0DJ93 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM13P0DJ93 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM13P0DJ93 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM13P0DJ93 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM13P0DJ93 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM13P0DJ93 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM13P0DJ93 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM13P0DJ93 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM13P0DJ93 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM13P0DJ93 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM13P0DJ93 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM13P0DJ93 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM13P0DJ93 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM13P0DJ93 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM13P0DJ93 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM13P0DJ93 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM13P0DJ93 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM13P0DJ93 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM13P0DJ93 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM13P0DJ93 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM13P0DJ93 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM13P0DJ93 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM13P0DJ93 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM13P0DJ93 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM13P0DJ93 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM13P0DJ93 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM13P0DJ93 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM13P0DJ93 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM13P0DJ93 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM13P0DJ93 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM13P0DJ93 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM13P0DJ93 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM13P0DJ93 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM13P0DJ93 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM13P0DJ93 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM13P0DJ93 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM13P0DJ93 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM13P0DJ93 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM13P0DJ93 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM13P0DJ93 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM13P0DJ93 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM13P0DJ93 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM13P0DJ93 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM13P0DJ93 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM13P0DJ93 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM13P0DJ93 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM13P0DJ93 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMIM13P0DJ93 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMIM13P0DJ93 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM13P0DJ93 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM13P0DJ93 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM13P0DJ93 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM13P0DJ93 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM13P0DJ93 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM13P0DJ93 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM13P0DJ93 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM13P0DJ93 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM13P0DJ93 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM13P0DJ93 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM13P0DJ93 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM13P0DJ93 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM13P0DJ93 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM13P0DJ93 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM13P0DJ93 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM13P0DJ93 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM13P0DJ93 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM13P0DJ93 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM13P0DJ93 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM13P0DJ93 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM13P0DJ93 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM13P0DJ93 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM13P0DJ93 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM13P0DJ93 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM13P0DJ93 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM13P0DJ93 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM13P0DJ93 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM13P0DJ93 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM13P0DJ93 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM13P0DJ93 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM13P0DJ93 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM13P0DJ93 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM13P0DJ93 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM13P0DJ93 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM13P0DJ93 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM13P0DJ93 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM13P0DJ93 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM13P0DJ93 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM13P0DJ93 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM13P0DJ93 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM13P0DJ93 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM13P0DJ93 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM13P0DJ93 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms