Protein–RNA interactions for Protein: P0CAP2

POLR2M, DNA-directed RNA polymerase II subunit GRINL1A, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2MP0CAP2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR2MP0CAP2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR2MP0CAP2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR2MP0CAP2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR2MP0CAP2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR2MP0CAP2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR2MP0CAP2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR2MP0CAP2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR2MP0CAP2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR2MP0CAP2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR2MP0CAP2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR2MP0CAP2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLR2MP0CAP2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLR2MP0CAP2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLR2MP0CAP2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLR2MP0CAP2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
POLR2MP0CAP2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLR2MP0CAP2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLR2MP0CAP2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
POLR2MP0CAP2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR2MP0CAP2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR2MP0CAP2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR2MP0CAP2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR2MP0CAP2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR2MP0CAP2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR2MP0CAP2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
POLR2MP0CAP2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLR2MP0CAP2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLR2MP0CAP2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLR2MP0CAP2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLR2MP0CAP2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLR2MP0CAP2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLR2MP0CAP2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
POLR2MP0CAP2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
POLR2MP0CAP2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27■■□□□ 1.91
POLR2MP0CAP2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27■■□□□ 1.91
POLR2MP0CAP2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27■■□□□ 1.91
POLR2MP0CAP2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
POLR2MP0CAP2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
POLR2MP0CAP2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
POLR2MP0CAP2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLR2MP0CAP2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLR2MP0CAP2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLR2MP0CAP2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLR2MP0CAP2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLR2MP0CAP2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLR2MP0CAP2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
POLR2MP0CAP2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR2MP0CAP2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR2MP0CAP2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR2MP0CAP2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR2MP0CAP2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR2MP0CAP2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
POLR2MP0CAP2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLR2MP0CAP2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLR2MP0CAP2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLR2MP0CAP2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLR2MP0CAP2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLR2MP0CAP2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLR2MP0CAP2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLR2MP0CAP2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLR2MP0CAP2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLR2MP0CAP2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
POLR2MP0CAP2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
POLR2MP0CAP2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
POLR2MP0CAP2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLR2MP0CAP2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLR2MP0CAP2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
POLR2MP0CAP2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLR2MP0CAP2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLR2MP0CAP2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLR2MP0CAP2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLR2MP0CAP2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR2MP0CAP2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR2MP0CAP2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR2MP0CAP2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR2MP0CAP2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR2MP0CAP2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR2MP0CAP2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR2MP0CAP2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR2MP0CAP2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR2MP0CAP2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR2MP0CAP2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR2MP0CAP2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR2MP0CAP2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR2MP0CAP2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR2MP0CAP2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR2MP0CAP2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR2MP0CAP2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR2MP0CAP2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR2MP0CAP2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR2MP0CAP2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR2MP0CAP2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR2MP0CAP2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR2MP0CAP2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR2MP0CAP2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR2MP0CAP2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR2MP0CAP2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR2MP0CAP2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLR2MP0CAP2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms