Protein–RNA interactions for Protein: P0C7H9

USP17L7, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L7P0C7H9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP17L7P0C7H9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP17L7P0C7H9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP17L7P0C7H9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP17L7P0C7H9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP17L7P0C7H9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP17L7P0C7H9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP17L7P0C7H9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP17L7P0C7H9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP17L7P0C7H9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP17L7P0C7H9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP17L7P0C7H9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP17L7P0C7H9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP17L7P0C7H9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP17L7P0C7H9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
USP17L7P0C7H9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP17L7P0C7H9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP17L7P0C7H9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP17L7P0C7H9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP17L7P0C7H9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP17L7P0C7H9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP17L7P0C7H9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP17L7P0C7H9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP17L7P0C7H9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP17L7P0C7H9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP17L7P0C7H9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP17L7P0C7H9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP17L7P0C7H9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP17L7P0C7H9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP17L7P0C7H9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP17L7P0C7H9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP17L7P0C7H9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP17L7P0C7H9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP17L7P0C7H9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
USP17L7P0C7H9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP17L7P0C7H9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
USP17L7P0C7H9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP17L7P0C7H9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP17L7P0C7H9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP17L7P0C7H9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP17L7P0C7H9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP17L7P0C7H9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
USP17L7P0C7H9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP17L7P0C7H9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP17L7P0C7H9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP17L7P0C7H9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L7P0C7H9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L7P0C7H9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L7P0C7H9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L7P0C7H9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L7P0C7H9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L7P0C7H9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L7P0C7H9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
USP17L7P0C7H9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP17L7P0C7H9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
USP17L7P0C7H9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP17L7P0C7H9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP17L7P0C7H9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP17L7P0C7H9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP17L7P0C7H9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP17L7P0C7H9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP17L7P0C7H9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP17L7P0C7H9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L7P0C7H9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L7P0C7H9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L7P0C7H9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L7P0C7H9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L7P0C7H9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L7P0C7H9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L7P0C7H9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L7P0C7H9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
USP17L7P0C7H9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L7P0C7H9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L7P0C7H9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L7P0C7H9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L7P0C7H9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L7P0C7H9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L7P0C7H9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L7P0C7H9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L7P0C7H9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L7P0C7H9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L7P0C7H9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L7P0C7H9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L7P0C7H9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L7P0C7H9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L7P0C7H9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L7P0C7H9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L7P0C7H9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L7P0C7H9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L7P0C7H9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L7P0C7H9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L7P0C7H9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L7P0C7H9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L7P0C7H9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L7P0C7H9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L7P0C7H9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L7P0C7H9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L7P0C7H9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L7P0C7H9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L7P0C7H9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms