Protein–RNA interactions for Protein: P08493

MGP, Matrix Gla protein, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGPP08493 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MGPP08493 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MGPP08493 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MGPP08493 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MGPP08493 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MGPP08493 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MGPP08493 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MGPP08493 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MGPP08493 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MGPP08493 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MGPP08493 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MGPP08493 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MGPP08493 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MGPP08493 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
MGPP08493 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
MGPP08493 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
MGPP08493 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MGPP08493 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MGPP08493 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MGPP08493 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MGPP08493 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MGPP08493 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MGPP08493 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MGPP08493 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MGPP08493 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MGPP08493 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MGPP08493 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MGPP08493 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MGPP08493 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MGPP08493 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MGPP08493 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MGPP08493 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MGPP08493 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MGPP08493 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MGPP08493 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MGPP08493 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MGPP08493 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MGPP08493 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MGPP08493 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MGPP08493 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MGPP08493 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MGPP08493 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MGPP08493 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MGPP08493 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MGPP08493 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MGPP08493 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MGPP08493 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MGPP08493 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MGPP08493 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MGPP08493 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MGPP08493 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MGPP08493 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MGPP08493 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MGPP08493 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MGPP08493 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MGPP08493 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MGPP08493 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MGPP08493 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MGPP08493 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MGPP08493 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MGPP08493 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MGPP08493 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MGPP08493 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MGPP08493 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MGPP08493 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MGPP08493 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MGPP08493 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MGPP08493 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MGPP08493 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MGPP08493 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MGPP08493 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MGPP08493 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MGPP08493 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MGPP08493 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MGPP08493 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MGPP08493 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MGPP08493 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MGPP08493 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MGPP08493 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MGPP08493 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MGPP08493 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MGPP08493 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MGPP08493 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MGPP08493 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MGPP08493 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MGPP08493 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MGPP08493 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MGPP08493 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MGPP08493 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MGPP08493 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MGPP08493 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
MGPP08493 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MGPP08493 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MGPP08493 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MGPP08493 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MGPP08493 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MGPP08493 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MGPP08493 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MGPP08493 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MGPP08493 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms