Protein–RNA interactions for Protein: P07437

TUBB, Tubulin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBBP07437 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBBP07437 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBBP07437 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBBP07437 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBBP07437 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBBP07437 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBBP07437 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBBP07437 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBBP07437 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBBP07437 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBBP07437 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBBP07437 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBBP07437 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBBP07437 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBBP07437 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBBP07437 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBBP07437 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBBP07437 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBBP07437 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBBP07437 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBBP07437 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBBP07437 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBBP07437 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBBP07437 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBBP07437 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBBP07437 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBBP07437 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TUBBP07437 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBBP07437 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBBP07437 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBBP07437 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBBP07437 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBBP07437 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBBP07437 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBBP07437 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBBP07437 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBBP07437 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBBP07437 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBBP07437 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBBP07437 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBBP07437 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBBP07437 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBBP07437 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBBP07437 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBBP07437 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBBP07437 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBBP07437 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBBP07437 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBBP07437 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBBP07437 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBBP07437 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBBP07437 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBBP07437 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBBP07437 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBBP07437 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBBP07437 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBBP07437 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBBP07437 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBBP07437 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBBP07437 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBBP07437 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBBP07437 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBBP07437 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBBP07437 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBBP07437 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBBP07437 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBBP07437 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBBP07437 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBBP07437 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBBP07437 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBBP07437 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBBP07437 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBBP07437 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBBP07437 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBBP07437 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBBP07437 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBBP07437 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBBP07437 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBBP07437 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBBP07437 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBBP07437 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBBP07437 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBBP07437 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBBP07437 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBBP07437 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBBP07437 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBBP07437 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBBP07437 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBBP07437 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBBP07437 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBBP07437 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBBP07437 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBBP07437 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBBP07437 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBBP07437 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBBP07437 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBBP07437 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBBP07437 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBBP07437 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBBP07437 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms