Protein–RNA interactions for Protein: P05549

TFAP2A, Transcription factor AP-2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP2AP05549 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFAP2AP05549 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFAP2AP05549 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFAP2AP05549 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFAP2AP05549 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFAP2AP05549 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFAP2AP05549 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFAP2AP05549 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFAP2AP05549 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFAP2AP05549 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFAP2AP05549 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFAP2AP05549 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFAP2AP05549 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFAP2AP05549 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFAP2AP05549 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFAP2AP05549 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFAP2AP05549 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TFAP2AP05549 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TFAP2AP05549 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TFAP2AP05549 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TFAP2AP05549 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFAP2AP05549 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFAP2AP05549 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFAP2AP05549 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFAP2AP05549 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TFAP2AP05549 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TFAP2AP05549 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFAP2AP05549 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFAP2AP05549 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFAP2AP05549 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFAP2AP05549 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFAP2AP05549 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFAP2AP05549 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFAP2AP05549 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFAP2AP05549 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFAP2AP05549 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFAP2AP05549 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFAP2AP05549 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFAP2AP05549 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFAP2AP05549 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFAP2AP05549 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFAP2AP05549 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFAP2AP05549 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFAP2AP05549 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFAP2AP05549 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFAP2AP05549 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TFAP2AP05549 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFAP2AP05549 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFAP2AP05549 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFAP2AP05549 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFAP2AP05549 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFAP2AP05549 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFAP2AP05549 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFAP2AP05549 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFAP2AP05549 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFAP2AP05549 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFAP2AP05549 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFAP2AP05549 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFAP2AP05549 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFAP2AP05549 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFAP2AP05549 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFAP2AP05549 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFAP2AP05549 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFAP2AP05549 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFAP2AP05549 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFAP2AP05549 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFAP2AP05549 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFAP2AP05549 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFAP2AP05549 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFAP2AP05549 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TFAP2AP05549 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TFAP2AP05549 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TFAP2AP05549 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TFAP2AP05549 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TFAP2AP05549 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TFAP2AP05549 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TFAP2AP05549 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TFAP2AP05549 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TFAP2AP05549 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TFAP2AP05549 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TFAP2AP05549 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFAP2AP05549 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFAP2AP05549 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFAP2AP05549 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFAP2AP05549 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFAP2AP05549 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFAP2AP05549 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFAP2AP05549 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFAP2AP05549 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TFAP2AP05549 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFAP2AP05549 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFAP2AP05549 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFAP2AP05549 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFAP2AP05549 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFAP2AP05549 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFAP2AP05549 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFAP2AP05549 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TFAP2AP05549 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TFAP2AP05549 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TFAP2AP05549 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms