Protein–RNA interactions for Protein: P05452

CLEC3B, Tetranectin, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC3BP05452 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLEC3BP05452 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLEC3BP05452 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLEC3BP05452 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLEC3BP05452 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLEC3BP05452 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLEC3BP05452 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLEC3BP05452 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLEC3BP05452 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLEC3BP05452 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLEC3BP05452 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLEC3BP05452 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLEC3BP05452 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLEC3BP05452 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLEC3BP05452 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLEC3BP05452 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLEC3BP05452 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLEC3BP05452 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLEC3BP05452 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLEC3BP05452 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLEC3BP05452 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLEC3BP05452 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLEC3BP05452 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLEC3BP05452 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLEC3BP05452 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLEC3BP05452 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CLEC3BP05452 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLEC3BP05452 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLEC3BP05452 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLEC3BP05452 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLEC3BP05452 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLEC3BP05452 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLEC3BP05452 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLEC3BP05452 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLEC3BP05452 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CLEC3BP05452 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLEC3BP05452 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CLEC3BP05452 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLEC3BP05452 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLEC3BP05452 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLEC3BP05452 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLEC3BP05452 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLEC3BP05452 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLEC3BP05452 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLEC3BP05452 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLEC3BP05452 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLEC3BP05452 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLEC3BP05452 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLEC3BP05452 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLEC3BP05452 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLEC3BP05452 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLEC3BP05452 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLEC3BP05452 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLEC3BP05452 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLEC3BP05452 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLEC3BP05452 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLEC3BP05452 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CLEC3BP05452 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CLEC3BP05452 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLEC3BP05452 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLEC3BP05452 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLEC3BP05452 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLEC3BP05452 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLEC3BP05452 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLEC3BP05452 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLEC3BP05452 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CLEC3BP05452 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLEC3BP05452 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLEC3BP05452 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLEC3BP05452 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLEC3BP05452 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLEC3BP05452 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLEC3BP05452 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLEC3BP05452 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLEC3BP05452 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLEC3BP05452 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLEC3BP05452 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLEC3BP05452 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLEC3BP05452 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLEC3BP05452 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLEC3BP05452 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CLEC3BP05452 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CLEC3BP05452 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLEC3BP05452 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLEC3BP05452 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLEC3BP05452 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLEC3BP05452 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLEC3BP05452 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLEC3BP05452 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLEC3BP05452 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLEC3BP05452 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLEC3BP05452 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLEC3BP05452 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLEC3BP05452 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CLEC3BP05452 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLEC3BP05452 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLEC3BP05452 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLEC3BP05452 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLEC3BP05452 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLEC3BP05452 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms