Protein–RNA interactions for Protein: P04629

NTRK1, High affinity nerve growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK1P04629 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NTRK1P04629 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NTRK1P04629 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NTRK1P04629 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NTRK1P04629 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NTRK1P04629 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NTRK1P04629 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NTRK1P04629 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NTRK1P04629 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NTRK1P04629 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NTRK1P04629 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NTRK1P04629 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NTRK1P04629 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NTRK1P04629 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NTRK1P04629 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NTRK1P04629 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NTRK1P04629 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NTRK1P04629 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NTRK1P04629 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NTRK1P04629 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NTRK1P04629 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NTRK1P04629 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NTRK1P04629 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NTRK1P04629 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NTRK1P04629 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NTRK1P04629 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NTRK1P04629 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NTRK1P04629 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NTRK1P04629 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NTRK1P04629 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NTRK1P04629 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NTRK1P04629 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NTRK1P04629 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NTRK1P04629 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NTRK1P04629 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NTRK1P04629 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NTRK1P04629 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NTRK1P04629 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NTRK1P04629 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NTRK1P04629 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NTRK1P04629 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NTRK1P04629 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NTRK1P04629 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NTRK1P04629 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
NTRK1P04629 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NTRK1P04629 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NTRK1P04629 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NTRK1P04629 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NTRK1P04629 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NTRK1P04629 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NTRK1P04629 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NTRK1P04629 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NTRK1P04629 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NTRK1P04629 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NTRK1P04629 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NTRK1P04629 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NTRK1P04629 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NTRK1P04629 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NTRK1P04629 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NTRK1P04629 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NTRK1P04629 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NTRK1P04629 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NTRK1P04629 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NTRK1P04629 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NTRK1P04629 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NTRK1P04629 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NTRK1P04629 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NTRK1P04629 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NTRK1P04629 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NTRK1P04629 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NTRK1P04629 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NTRK1P04629 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NTRK1P04629 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NTRK1P04629 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NTRK1P04629 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NTRK1P04629 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NTRK1P04629 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NTRK1P04629 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NTRK1P04629 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NTRK1P04629 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NTRK1P04629 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NTRK1P04629 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NTRK1P04629 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NTRK1P04629 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NTRK1P04629 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NTRK1P04629 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NTRK1P04629 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NTRK1P04629 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NTRK1P04629 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NTRK1P04629 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NTRK1P04629 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NTRK1P04629 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NTRK1P04629 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NTRK1P04629 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NTRK1P04629 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NTRK1P04629 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NTRK1P04629 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NTRK1P04629 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NTRK1P04629 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NTRK1P04629 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms