Protein–RNA interactions for Protein: P04264

KRT1, Keratin, type II cytoskeletal 1, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT1P04264 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT1P04264 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT1P04264 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT1P04264 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT1P04264 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT1P04264 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT1P04264 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT1P04264 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT1P04264 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT1P04264 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT1P04264 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT1P04264 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT1P04264 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT1P04264 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT1P04264 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT1P04264 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT1P04264 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT1P04264 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT1P04264 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT1P04264 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT1P04264 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KRT1P04264 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KRT1P04264 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT1P04264 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT1P04264 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT1P04264 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT1P04264 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT1P04264 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT1P04264 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT1P04264 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT1P04264 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT1P04264 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT1P04264 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT1P04264 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT1P04264 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT1P04264 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT1P04264 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT1P04264 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT1P04264 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT1P04264 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT1P04264 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT1P04264 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT1P04264 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT1P04264 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT1P04264 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT1P04264 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT1P04264 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT1P04264 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT1P04264 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT1P04264 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT1P04264 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT1P04264 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT1P04264 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT1P04264 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT1P04264 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT1P04264 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT1P04264 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT1P04264 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT1P04264 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT1P04264 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT1P04264 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT1P04264 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT1P04264 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT1P04264 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT1P04264 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT1P04264 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT1P04264 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT1P04264 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT1P04264 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT1P04264 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT1P04264 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT1P04264 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT1P04264 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT1P04264 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT1P04264 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT1P04264 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT1P04264 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT1P04264 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT1P04264 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT1P04264 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT1P04264 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT1P04264 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT1P04264 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT1P04264 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT1P04264 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT1P04264 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT1P04264 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT1P04264 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT1P04264 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT1P04264 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT1P04264 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT1P04264 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT1P04264 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT1P04264 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT1P04264 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT1P04264 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT1P04264 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT1P04264 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT1P04264 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT1P04264 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms