Protein–RNA interactions for Protein: P03999

OPN1SW, Short-wave-sensitive opsin 1, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN1SWP03999 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OPN1SWP03999 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OPN1SWP03999 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OPN1SWP03999 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OPN1SWP03999 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OPN1SWP03999 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OPN1SWP03999 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
OPN1SWP03999 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OPN1SWP03999 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OPN1SWP03999 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OPN1SWP03999 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
OPN1SWP03999 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OPN1SWP03999 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OPN1SWP03999 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OPN1SWP03999 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OPN1SWP03999 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OPN1SWP03999 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OPN1SWP03999 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OPN1SWP03999 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OPN1SWP03999 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OPN1SWP03999 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OPN1SWP03999 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OPN1SWP03999 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OPN1SWP03999 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OPN1SWP03999 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OPN1SWP03999 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OPN1SWP03999 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OPN1SWP03999 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OPN1SWP03999 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OPN1SWP03999 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OPN1SWP03999 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
OPN1SWP03999 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
OPN1SWP03999 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OPN1SWP03999 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
OPN1SWP03999 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
OPN1SWP03999 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OPN1SWP03999 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OPN1SWP03999 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
OPN1SWP03999 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OPN1SWP03999 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OPN1SWP03999 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OPN1SWP03999 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OPN1SWP03999 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OPN1SWP03999 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
OPN1SWP03999 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
OPN1SWP03999 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OPN1SWP03999 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OPN1SWP03999 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OPN1SWP03999 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OPN1SWP03999 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OPN1SWP03999 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
OPN1SWP03999 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
OPN1SWP03999 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
OPN1SWP03999 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OPN1SWP03999 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OPN1SWP03999 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OPN1SWP03999 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
OPN1SWP03999 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OPN1SWP03999 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OPN1SWP03999 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OPN1SWP03999 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OPN1SWP03999 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
OPN1SWP03999 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OPN1SWP03999 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OPN1SWP03999 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OPN1SWP03999 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OPN1SWP03999 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
OPN1SWP03999 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
OPN1SWP03999 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OPN1SWP03999 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
OPN1SWP03999 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
OPN1SWP03999 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
OPN1SWP03999 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
OPN1SWP03999 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
OPN1SWP03999 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
OPN1SWP03999 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
OPN1SWP03999 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
OPN1SWP03999 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
OPN1SWP03999 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
OPN1SWP03999 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
OPN1SWP03999 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
OPN1SWP03999 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
OPN1SWP03999 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
OPN1SWP03999 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
OPN1SWP03999 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
OPN1SWP03999 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
OPN1SWP03999 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
OPN1SWP03999 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OPN1SWP03999 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
OPN1SWP03999 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OPN1SWP03999 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OPN1SWP03999 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
OPN1SWP03999 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OPN1SWP03999 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OPN1SWP03999 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
OPN1SWP03999 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
OPN1SWP03999 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
OPN1SWP03999 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OPN1SWP03999 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
OPN1SWP03999 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms