Protein–RNA interactions for Protein: P02679

FGG, Fibrinogen gamma chain, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGGP02679 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGGP02679 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGGP02679 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGGP02679 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGGP02679 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGGP02679 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGGP02679 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGGP02679 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGGP02679 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGGP02679 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGGP02679 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGGP02679 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FGGP02679 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FGGP02679 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FGGP02679 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FGGP02679 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FGGP02679 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FGGP02679 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
FGGP02679 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FGGP02679 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FGGP02679 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FGGP02679 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FGGP02679 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FGGP02679 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FGGP02679 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FGGP02679 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
FGGP02679 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
FGGP02679 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FGGP02679 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FGGP02679 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FGGP02679 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FGGP02679 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FGGP02679 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FGGP02679 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FGGP02679 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FGGP02679 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FGGP02679 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FGGP02679 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FGGP02679 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FGGP02679 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FGGP02679 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FGGP02679 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FGGP02679 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FGGP02679 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FGGP02679 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FGGP02679 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FGGP02679 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
FGGP02679 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FGGP02679 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FGGP02679 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FGGP02679 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FGGP02679 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FGGP02679 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FGGP02679 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FGGP02679 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FGGP02679 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FGGP02679 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FGGP02679 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FGGP02679 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FGGP02679 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FGGP02679 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FGGP02679 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FGGP02679 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FGGP02679 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FGGP02679 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FGGP02679 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FGGP02679 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FGGP02679 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FGGP02679 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FGGP02679 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FGGP02679 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FGGP02679 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FGGP02679 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FGGP02679 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FGGP02679 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FGGP02679 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FGGP02679 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FGGP02679 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FGGP02679 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FGGP02679 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FGGP02679 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FGGP02679 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FGGP02679 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FGGP02679 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
FGGP02679 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FGGP02679 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FGGP02679 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FGGP02679 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FGGP02679 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FGGP02679 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FGGP02679 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FGGP02679 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FGGP02679 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FGGP02679 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FGGP02679 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FGGP02679 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FGGP02679 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FGGP02679 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FGGP02679 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FGGP02679 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms