Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FGAP02671 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FGAP02671 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FGAP02671 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FGAP02671 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FGAP02671 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FGAP02671 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FGAP02671 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FGAP02671 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FGAP02671 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FGAP02671 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FGAP02671 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FGAP02671 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FGAP02671 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FGAP02671 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FGAP02671 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FGAP02671 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FGAP02671 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
FGAP02671 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FGAP02671 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FGAP02671 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FGAP02671 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FGAP02671 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FGAP02671 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FGAP02671 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FGAP02671 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FGAP02671 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FGAP02671 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FGAP02671 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
FGAP02671 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FGAP02671 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FGAP02671 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FGAP02671 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FGAP02671 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
FGAP02671 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FGAP02671 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FGAP02671 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FGAP02671 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FGAP02671 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
FGAP02671 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FGAP02671 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FGAP02671 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FGAP02671 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FGAP02671 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FGAP02671 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FGAP02671 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FGAP02671 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FGAP02671 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FGAP02671 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FGAP02671 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FGAP02671 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FGAP02671 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FGAP02671 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FGAP02671 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FGAP02671 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
FGAP02671 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FGAP02671 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FGAP02671 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FGAP02671 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FGAP02671 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FGAP02671 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FGAP02671 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FGAP02671 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
FGAP02671 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FGAP02671 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FGAP02671 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FGAP02671 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FGAP02671 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
FGAP02671 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FGAP02671 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FGAP02671 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FGAP02671 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FGAP02671 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FGAP02671 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FGAP02671 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FGAP02671 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FGAP02671 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FGAP02671 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FGAP02671 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FGAP02671 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FGAP02671 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FGAP02671 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FGAP02671 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FGAP02671 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FGAP02671 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
FGAP02671 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FGAP02671 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FGAP02671 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FGAP02671 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FGAP02671 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FGAP02671 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FGAP02671 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FGAP02671 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FGAP02671 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FGAP02671 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FGAP02671 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FGAP02671 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FGAP02671 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FGAP02671 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FGAP02671 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms