Protein–RNA interactions for Protein: P01737

T-cell receptor alpha chain V region PY14, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01737 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01737 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01737 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01737 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01737 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01737 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01737 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01737 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01737 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01737 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
P01737 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01737 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01737 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
P01737 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01737 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01737 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01737 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01737 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01737 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01737 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01737 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01737 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01737 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
P01737 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
P01737 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01737 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01737 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01737 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01737 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01737 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01737 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01737 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01737 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01737 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01737 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01737 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01737 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01737 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01737 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01737 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01737 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01737 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01737 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01737 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01737 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01737 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01737 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01737 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01737 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01737 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01737 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01737 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01737 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01737 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01737 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01737 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01737 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01737 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01737 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01737 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01737 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01737 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01737 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01737 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
P01737 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01737 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01737 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01737 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01737 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
P01737 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
P01737 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
P01737 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
P01737 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
P01737 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
P01737 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
P01737 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
P01737 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
P01737 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
P01737 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
P01737 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01737 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01737 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01737 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01737 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01737 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01737 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01737 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01737 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01737 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01737 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01737 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01737 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01737 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01737 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01737 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01737 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01737 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01737 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01737 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01737 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms