Protein–RNA interactions for Protein: P01189

POMC, Pro-opiomelanocortin, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMCP01189 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
POMCP01189 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POMCP01189 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
POMCP01189 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
POMCP01189 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POMCP01189 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POMCP01189 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POMCP01189 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
POMCP01189 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POMCP01189 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POMCP01189 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POMCP01189 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
POMCP01189 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POMCP01189 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
POMCP01189 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
POMCP01189 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
POMCP01189 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
POMCP01189 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
POMCP01189 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POMCP01189 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POMCP01189 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POMCP01189 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POMCP01189 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
POMCP01189 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POMCP01189 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POMCP01189 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POMCP01189 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POMCP01189 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POMCP01189 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POMCP01189 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POMCP01189 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
POMCP01189 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POMCP01189 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POMCP01189 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POMCP01189 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POMCP01189 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POMCP01189 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POMCP01189 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POMCP01189 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POMCP01189 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POMCP01189 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POMCP01189 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POMCP01189 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POMCP01189 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POMCP01189 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POMCP01189 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POMCP01189 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POMCP01189 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POMCP01189 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POMCP01189 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POMCP01189 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POMCP01189 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POMCP01189 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POMCP01189 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POMCP01189 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POMCP01189 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POMCP01189 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POMCP01189 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POMCP01189 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
POMCP01189 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POMCP01189 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POMCP01189 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POMCP01189 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POMCP01189 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
POMCP01189 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POMCP01189 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POMCP01189 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POMCP01189 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POMCP01189 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POMCP01189 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POMCP01189 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
POMCP01189 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POMCP01189 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POMCP01189 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
POMCP01189 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
POMCP01189 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
POMCP01189 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
POMCP01189 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
POMCP01189 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
POMCP01189 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POMCP01189 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POMCP01189 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POMCP01189 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POMCP01189 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POMCP01189 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POMCP01189 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
POMCP01189 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POMCP01189 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POMCP01189 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POMCP01189 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POMCP01189 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POMCP01189 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POMCP01189 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POMCP01189 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POMCP01189 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POMCP01189 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POMCP01189 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POMCP01189 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POMCP01189 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POMCP01189 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms