Protein–RNA interactions for Protein: P00736

C1R, Complement C1r subcomponent, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1RP00736 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C1RP00736 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C1RP00736 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C1RP00736 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C1RP00736 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C1RP00736 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C1RP00736 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C1RP00736 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C1RP00736 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C1RP00736 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C1RP00736 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C1RP00736 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C1RP00736 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C1RP00736 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C1RP00736 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C1RP00736 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C1RP00736 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C1RP00736 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C1RP00736 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C1RP00736 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C1RP00736 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C1RP00736 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
C1RP00736 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
C1RP00736 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C1RP00736 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C1RP00736 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C1RP00736 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C1RP00736 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C1RP00736 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
C1RP00736 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C1RP00736 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C1RP00736 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
C1RP00736 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25■■□□□ 1.59
C1RP00736 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
C1RP00736 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
C1RP00736 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C1RP00736 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25■■□□□ 1.59
C1RP00736 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
C1RP00736 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C1RP00736 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
C1RP00736 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C1RP00736 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C1RP00736 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C1RP00736 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
C1RP00736 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C1RP00736 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C1RP00736 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C1RP00736 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C1RP00736 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C1RP00736 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C1RP00736 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C1RP00736 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C1RP00736 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C1RP00736 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C1RP00736 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C1RP00736 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C1RP00736 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C1RP00736 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C1RP00736 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C1RP00736 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C1RP00736 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C1RP00736 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C1RP00736 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C1RP00736 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C1RP00736 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C1RP00736 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C1RP00736 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
C1RP00736 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C1RP00736 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C1RP00736 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C1RP00736 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C1RP00736 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C1RP00736 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C1RP00736 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C1RP00736 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C1RP00736 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C1RP00736 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C1RP00736 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C1RP00736 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C1RP00736 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C1RP00736 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C1RP00736 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C1RP00736 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C1RP00736 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C1RP00736 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C1RP00736 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C1RP00736 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C1RP00736 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
C1RP00736 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C1RP00736 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C1RP00736 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C1RP00736 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C1RP00736 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
C1RP00736 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C1RP00736 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C1RP00736 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C1RP00736 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C1RP00736 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C1RP00736 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C1RP00736 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms