Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MBD3O95983 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MBD3O95983 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MBD3O95983 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MBD3O95983 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MBD3O95983 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
MBD3O95983 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
MBD3O95983 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
MBD3O95983 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
MBD3O95983 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
MBD3O95983 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
MBD3O95983 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
MBD3O95983 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
MBD3O95983 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
MBD3O95983 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MBD3O95983 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MBD3O95983 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
MBD3O95983 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MBD3O95983 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MBD3O95983 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
MBD3O95983 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MBD3O95983 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MBD3O95983 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MBD3O95983 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MBD3O95983 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MBD3O95983 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MBD3O95983 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MBD3O95983 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MBD3O95983 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27■■□□□ 1.91
MBD3O95983 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
MBD3O95983 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MBD3O95983 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MBD3O95983 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MBD3O95983 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MBD3O95983 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MBD3O95983 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MBD3O95983 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MBD3O95983 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MBD3O95983 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MBD3O95983 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MBD3O95983 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MBD3O95983 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MBD3O95983 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MBD3O95983 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MBD3O95983 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MBD3O95983 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MBD3O95983 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MBD3O95983 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MBD3O95983 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MBD3O95983 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MBD3O95983 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MBD3O95983 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MBD3O95983 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MBD3O95983 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MBD3O95983 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MBD3O95983 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MBD3O95983 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MBD3O95983 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MBD3O95983 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MBD3O95983 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MBD3O95983 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MBD3O95983 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MBD3O95983 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MBD3O95983 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MBD3O95983 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MBD3O95983 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MBD3O95983 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MBD3O95983 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MBD3O95983 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MBD3O95983 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MBD3O95983 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MBD3O95983 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MBD3O95983 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MBD3O95983 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MBD3O95983 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MBD3O95983 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MBD3O95983 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MBD3O95983 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MBD3O95983 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MBD3O95983 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MBD3O95983 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MBD3O95983 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MBD3O95983 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MBD3O95983 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MBD3O95983 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MBD3O95983 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
MBD3O95983 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MBD3O95983 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MBD3O95983 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MBD3O95983 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MBD3O95983 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MBD3O95983 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MBD3O95983 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
MBD3O95983 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MBD3O95983 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MBD3O95983 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MBD3O95983 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MBD3O95983 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MBD3O95983 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MBD3O95983 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms