Protein–RNA interactions for Protein: O95721

SNAP29, Synaptosomal-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP29O95721 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
SNAP29O95721 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNAP29O95721 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNAP29O95721 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNAP29O95721 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNAP29O95721 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNAP29O95721 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNAP29O95721 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNAP29O95721 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNAP29O95721 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SNAP29O95721 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNAP29O95721 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNAP29O95721 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNAP29O95721 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNAP29O95721 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNAP29O95721 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNAP29O95721 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNAP29O95721 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNAP29O95721 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNAP29O95721 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNAP29O95721 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNAP29O95721 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SNAP29O95721 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNAP29O95721 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNAP29O95721 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNAP29O95721 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNAP29O95721 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNAP29O95721 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNAP29O95721 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNAP29O95721 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SNAP29O95721 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNAP29O95721 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SNAP29O95721 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNAP29O95721 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNAP29O95721 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNAP29O95721 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNAP29O95721 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNAP29O95721 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNAP29O95721 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNAP29O95721 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNAP29O95721 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNAP29O95721 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNAP29O95721 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNAP29O95721 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNAP29O95721 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNAP29O95721 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAP29O95721 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAP29O95721 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAP29O95721 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAP29O95721 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAP29O95721 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAP29O95721 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAP29O95721 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAP29O95721 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAP29O95721 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAP29O95721 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAP29O95721 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAP29O95721 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAP29O95721 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNAP29O95721 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNAP29O95721 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNAP29O95721 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNAP29O95721 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNAP29O95721 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNAP29O95721 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAP29O95721 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAP29O95721 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAP29O95721 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAP29O95721 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAP29O95721 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAP29O95721 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAP29O95721 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAP29O95721 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAP29O95721 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAP29O95721 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAP29O95721 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNAP29O95721 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNAP29O95721 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNAP29O95721 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNAP29O95721 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNAP29O95721 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNAP29O95721 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNAP29O95721 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNAP29O95721 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNAP29O95721 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNAP29O95721 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNAP29O95721 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNAP29O95721 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNAP29O95721 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNAP29O95721 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNAP29O95721 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNAP29O95721 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SNAP29O95721 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNAP29O95721 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNAP29O95721 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNAP29O95721 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNAP29O95721 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNAP29O95721 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNAP29O95721 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNAP29O95721 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms