Protein–RNA interactions for Protein: O95473

SYNGR4, Synaptogyrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR4O95473 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYNGR4O95473 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYNGR4O95473 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYNGR4O95473 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SYNGR4O95473 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYNGR4O95473 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYNGR4O95473 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYNGR4O95473 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SYNGR4O95473 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SYNGR4O95473 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SYNGR4O95473 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
SYNGR4O95473 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SYNGR4O95473 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYNGR4O95473 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYNGR4O95473 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYNGR4O95473 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYNGR4O95473 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYNGR4O95473 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYNGR4O95473 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYNGR4O95473 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYNGR4O95473 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYNGR4O95473 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYNGR4O95473 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYNGR4O95473 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNGR4O95473 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNGR4O95473 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNGR4O95473 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNGR4O95473 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNGR4O95473 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNGR4O95473 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNGR4O95473 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNGR4O95473 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNGR4O95473 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNGR4O95473 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNGR4O95473 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNGR4O95473 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNGR4O95473 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNGR4O95473 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNGR4O95473 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNGR4O95473 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNGR4O95473 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNGR4O95473 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNGR4O95473 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNGR4O95473 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNGR4O95473 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNGR4O95473 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNGR4O95473 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNGR4O95473 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNGR4O95473 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNGR4O95473 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNGR4O95473 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNGR4O95473 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNGR4O95473 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNGR4O95473 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYNGR4O95473 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYNGR4O95473 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SYNGR4O95473 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYNGR4O95473 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SYNGR4O95473 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYNGR4O95473 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYNGR4O95473 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYNGR4O95473 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SYNGR4O95473 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYNGR4O95473 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYNGR4O95473 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYNGR4O95473 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNGR4O95473 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNGR4O95473 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNGR4O95473 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNGR4O95473 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNGR4O95473 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNGR4O95473 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNGR4O95473 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNGR4O95473 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNGR4O95473 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNGR4O95473 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNGR4O95473 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNGR4O95473 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNGR4O95473 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNGR4O95473 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNGR4O95473 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNGR4O95473 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNGR4O95473 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNGR4O95473 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNGR4O95473 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNGR4O95473 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNGR4O95473 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNGR4O95473 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNGR4O95473 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNGR4O95473 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNGR4O95473 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNGR4O95473 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNGR4O95473 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNGR4O95473 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNGR4O95473 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNGR4O95473 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNGR4O95473 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNGR4O95473 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNGR4O95473 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNGR4O95473 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms