Protein–RNA interactions for Protein: O95239

KIF4A, Chromosome-associated kinesin KIF4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4AO95239 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KIF4AO95239 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KIF4AO95239 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KIF4AO95239 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KIF4AO95239 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KIF4AO95239 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KIF4AO95239 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KIF4AO95239 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KIF4AO95239 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KIF4AO95239 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KIF4AO95239 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KIF4AO95239 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KIF4AO95239 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KIF4AO95239 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KIF4AO95239 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KIF4AO95239 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KIF4AO95239 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KIF4AO95239 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KIF4AO95239 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
KIF4AO95239 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KIF4AO95239 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KIF4AO95239 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KIF4AO95239 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KIF4AO95239 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
KIF4AO95239 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KIF4AO95239 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KIF4AO95239 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KIF4AO95239 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KIF4AO95239 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KIF4AO95239 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KIF4AO95239 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KIF4AO95239 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KIF4AO95239 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
KIF4AO95239 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KIF4AO95239 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
KIF4AO95239 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KIF4AO95239 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KIF4AO95239 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KIF4AO95239 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KIF4AO95239 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KIF4AO95239 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KIF4AO95239 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KIF4AO95239 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KIF4AO95239 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KIF4AO95239 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KIF4AO95239 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KIF4AO95239 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KIF4AO95239 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KIF4AO95239 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KIF4AO95239 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KIF4AO95239 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
KIF4AO95239 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KIF4AO95239 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KIF4AO95239 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KIF4AO95239 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KIF4AO95239 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KIF4AO95239 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
KIF4AO95239 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KIF4AO95239 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KIF4AO95239 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KIF4AO95239 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KIF4AO95239 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KIF4AO95239 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KIF4AO95239 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KIF4AO95239 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KIF4AO95239 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KIF4AO95239 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KIF4AO95239 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KIF4AO95239 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KIF4AO95239 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KIF4AO95239 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KIF4AO95239 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KIF4AO95239 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KIF4AO95239 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
KIF4AO95239 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KIF4AO95239 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KIF4AO95239 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KIF4AO95239 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KIF4AO95239 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KIF4AO95239 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KIF4AO95239 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KIF4AO95239 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KIF4AO95239 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
KIF4AO95239 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KIF4AO95239 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KIF4AO95239 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KIF4AO95239 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KIF4AO95239 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KIF4AO95239 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KIF4AO95239 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KIF4AO95239 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KIF4AO95239 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KIF4AO95239 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KIF4AO95239 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KIF4AO95239 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KIF4AO95239 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KIF4AO95239 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KIF4AO95239 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KIF4AO95239 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KIF4AO95239 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms