Protein–RNA interactions for Protein: O95197

RTN3, Reticulon-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN3O95197 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RTN3O95197 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RTN3O95197 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RTN3O95197 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RTN3O95197 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RTN3O95197 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RTN3O95197 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTN3O95197 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTN3O95197 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTN3O95197 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTN3O95197 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTN3O95197 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTN3O95197 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTN3O95197 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTN3O95197 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTN3O95197 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTN3O95197 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RTN3O95197 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTN3O95197 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTN3O95197 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTN3O95197 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTN3O95197 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTN3O95197 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTN3O95197 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTN3O95197 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTN3O95197 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTN3O95197 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTN3O95197 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTN3O95197 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTN3O95197 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTN3O95197 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RTN3O95197 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTN3O95197 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTN3O95197 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTN3O95197 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTN3O95197 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTN3O95197 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTN3O95197 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTN3O95197 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTN3O95197 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTN3O95197 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RTN3O95197 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RTN3O95197 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RTN3O95197 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RTN3O95197 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RTN3O95197 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RTN3O95197 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RTN3O95197 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RTN3O95197 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTN3O95197 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTN3O95197 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RTN3O95197 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTN3O95197 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTN3O95197 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTN3O95197 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTN3O95197 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTN3O95197 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTN3O95197 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTN3O95197 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTN3O95197 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTN3O95197 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTN3O95197 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTN3O95197 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTN3O95197 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTN3O95197 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTN3O95197 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTN3O95197 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTN3O95197 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTN3O95197 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTN3O95197 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTN3O95197 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RTN3O95197 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTN3O95197 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTN3O95197 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTN3O95197 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTN3O95197 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTN3O95197 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTN3O95197 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTN3O95197 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RTN3O95197 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTN3O95197 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTN3O95197 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RTN3O95197 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTN3O95197 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTN3O95197 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTN3O95197 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTN3O95197 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTN3O95197 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTN3O95197 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTN3O95197 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTN3O95197 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RTN3O95197 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTN3O95197 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTN3O95197 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTN3O95197 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTN3O95197 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTN3O95197 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RTN3O95197 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTN3O95197 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTN3O95197 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms