Protein–RNA interactions for Protein: O94886

TMEM63A, CSC1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM63AO94886 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM63AO94886 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM63AO94886 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM63AO94886 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM63AO94886 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM63AO94886 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMEM63AO94886 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMEM63AO94886 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMEM63AO94886 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMEM63AO94886 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMEM63AO94886 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMEM63AO94886 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM63AO94886 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM63AO94886 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM63AO94886 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM63AO94886 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM63AO94886 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM63AO94886 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM63AO94886 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM63AO94886 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM63AO94886 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM63AO94886 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM63AO94886 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM63AO94886 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM63AO94886 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM63AO94886 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM63AO94886 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM63AO94886 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM63AO94886 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM63AO94886 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM63AO94886 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM63AO94886 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM63AO94886 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM63AO94886 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM63AO94886 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM63AO94886 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM63AO94886 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM63AO94886 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM63AO94886 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM63AO94886 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM63AO94886 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM63AO94886 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM63AO94886 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM63AO94886 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM63AO94886 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM63AO94886 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM63AO94886 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM63AO94886 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM63AO94886 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM63AO94886 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM63AO94886 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM63AO94886 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM63AO94886 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM63AO94886 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM63AO94886 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM63AO94886 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM63AO94886 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM63AO94886 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM63AO94886 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM63AO94886 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM63AO94886 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM63AO94886 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM63AO94886 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM63AO94886 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM63AO94886 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM63AO94886 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM63AO94886 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TMEM63AO94886 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM63AO94886 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM63AO94886 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM63AO94886 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM63AO94886 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM63AO94886 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM63AO94886 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM63AO94886 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM63AO94886 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM63AO94886 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM63AO94886 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM63AO94886 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM63AO94886 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM63AO94886 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM63AO94886 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM63AO94886 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM63AO94886 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM63AO94886 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM63AO94886 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM63AO94886 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM63AO94886 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM63AO94886 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM63AO94886 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM63AO94886 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM63AO94886 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM63AO94886 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM63AO94886 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM63AO94886 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM63AO94886 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM63AO94886 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TMEM63AO94886 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TMEM63AO94886 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM63AO94886 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.1 ms