Protein–RNA interactions for Protein: O75578

ITGA10, Integrin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA10O75578 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA10O75578 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA10O75578 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA10O75578 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA10O75578 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA10O75578 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA10O75578 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA10O75578 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA10O75578 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA10O75578 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA10O75578 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA10O75578 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA10O75578 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA10O75578 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA10O75578 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA10O75578 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA10O75578 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA10O75578 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA10O75578 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA10O75578 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA10O75578 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA10O75578 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA10O75578 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA10O75578 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA10O75578 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA10O75578 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA10O75578 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA10O75578 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA10O75578 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA10O75578 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA10O75578 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA10O75578 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA10O75578 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA10O75578 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA10O75578 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA10O75578 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA10O75578 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA10O75578 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA10O75578 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA10O75578 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA10O75578 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA10O75578 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA10O75578 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA10O75578 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA10O75578 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA10O75578 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA10O75578 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA10O75578 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA10O75578 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGA10O75578 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGA10O75578 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA10O75578 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA10O75578 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA10O75578 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA10O75578 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA10O75578 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA10O75578 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA10O75578 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA10O75578 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA10O75578 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA10O75578 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA10O75578 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA10O75578 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA10O75578 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA10O75578 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA10O75578 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA10O75578 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA10O75578 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA10O75578 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA10O75578 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA10O75578 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA10O75578 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA10O75578 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA10O75578 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA10O75578 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA10O75578 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA10O75578 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA10O75578 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA10O75578 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA10O75578 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA10O75578 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA10O75578 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA10O75578 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA10O75578 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA10O75578 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA10O75578 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA10O75578 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA10O75578 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA10O75578 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA10O75578 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA10O75578 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA10O75578 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA10O75578 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA10O75578 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA10O75578 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA10O75578 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA10O75578 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA10O75578 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA10O75578 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA10O75578 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms