Protein–RNA interactions for Protein: O75569

PRKRA, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRAO75569 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKRAO75569 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKRAO75569 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKRAO75569 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKRAO75569 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKRAO75569 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKRAO75569 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKRAO75569 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKRAO75569 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKRAO75569 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKRAO75569 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKRAO75569 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKRAO75569 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKRAO75569 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKRAO75569 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKRAO75569 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKRAO75569 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRKRAO75569 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRKRAO75569 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PRKRAO75569 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKRAO75569 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKRAO75569 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKRAO75569 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKRAO75569 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKRAO75569 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKRAO75569 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKRAO75569 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKRAO75569 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKRAO75569 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKRAO75569 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKRAO75569 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKRAO75569 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKRAO75569 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKRAO75569 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKRAO75569 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKRAO75569 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKRAO75569 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKRAO75569 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKRAO75569 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKRAO75569 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKRAO75569 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKRAO75569 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKRAO75569 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKRAO75569 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKRAO75569 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKRAO75569 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKRAO75569 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKRAO75569 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKRAO75569 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKRAO75569 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKRAO75569 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKRAO75569 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKRAO75569 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKRAO75569 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKRAO75569 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKRAO75569 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKRAO75569 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKRAO75569 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKRAO75569 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKRAO75569 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKRAO75569 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKRAO75569 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKRAO75569 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKRAO75569 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKRAO75569 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PRKRAO75569 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKRAO75569 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKRAO75569 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKRAO75569 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKRAO75569 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKRAO75569 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKRAO75569 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKRAO75569 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKRAO75569 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKRAO75569 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKRAO75569 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKRAO75569 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKRAO75569 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKRAO75569 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKRAO75569 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKRAO75569 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKRAO75569 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKRAO75569 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKRAO75569 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKRAO75569 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKRAO75569 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKRAO75569 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKRAO75569 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKRAO75569 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKRAO75569 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKRAO75569 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKRAO75569 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKRAO75569 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKRAO75569 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKRAO75569 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKRAO75569 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKRAO75569 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKRAO75569 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKRAO75569 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKRAO75569 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms