Protein–RNA interactions for Protein: O75452

RDH16, Retinol dehydrogenase 16, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH16O75452 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RDH16O75452 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RDH16O75452 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RDH16O75452 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RDH16O75452 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RDH16O75452 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RDH16O75452 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RDH16O75452 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RDH16O75452 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RDH16O75452 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RDH16O75452 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RDH16O75452 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RDH16O75452 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RDH16O75452 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RDH16O75452 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RDH16O75452 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RDH16O75452 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RDH16O75452 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RDH16O75452 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RDH16O75452 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RDH16O75452 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RDH16O75452 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RDH16O75452 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RDH16O75452 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RDH16O75452 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RDH16O75452 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RDH16O75452 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RDH16O75452 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RDH16O75452 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RDH16O75452 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RDH16O75452 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RDH16O75452 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RDH16O75452 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RDH16O75452 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RDH16O75452 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RDH16O75452 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RDH16O75452 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RDH16O75452 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RDH16O75452 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RDH16O75452 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RDH16O75452 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RDH16O75452 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RDH16O75452 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RDH16O75452 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RDH16O75452 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RDH16O75452 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RDH16O75452 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RDH16O75452 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RDH16O75452 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RDH16O75452 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RDH16O75452 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RDH16O75452 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RDH16O75452 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RDH16O75452 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RDH16O75452 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RDH16O75452 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RDH16O75452 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RDH16O75452 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RDH16O75452 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RDH16O75452 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RDH16O75452 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RDH16O75452 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RDH16O75452 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RDH16O75452 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RDH16O75452 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RDH16O75452 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RDH16O75452 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RDH16O75452 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RDH16O75452 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RDH16O75452 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RDH16O75452 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RDH16O75452 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RDH16O75452 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RDH16O75452 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RDH16O75452 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RDH16O75452 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RDH16O75452 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RDH16O75452 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RDH16O75452 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RDH16O75452 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RDH16O75452 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RDH16O75452 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RDH16O75452 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RDH16O75452 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RDH16O75452 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RDH16O75452 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RDH16O75452 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RDH16O75452 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RDH16O75452 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RDH16O75452 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RDH16O75452 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RDH16O75452 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RDH16O75452 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RDH16O75452 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RDH16O75452 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RDH16O75452 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RDH16O75452 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RDH16O75452 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RDH16O75452 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RDH16O75452 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms