Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
VAMP4O75379 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
VAMP4O75379 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
VAMP4O75379 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
VAMP4O75379 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
VAMP4O75379 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
VAMP4O75379 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
VAMP4O75379 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
VAMP4O75379 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
VAMP4O75379 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
VAMP4O75379 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
VAMP4O75379 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
VAMP4O75379 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
VAMP4O75379 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
VAMP4O75379 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
VAMP4O75379 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
VAMP4O75379 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
VAMP4O75379 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
VAMP4O75379 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
VAMP4O75379 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
VAMP4O75379 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
VAMP4O75379 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
VAMP4O75379 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
VAMP4O75379 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
VAMP4O75379 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
VAMP4O75379 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
VAMP4O75379 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
VAMP4O75379 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
VAMP4O75379 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
VAMP4O75379 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
VAMP4O75379 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
VAMP4O75379 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
VAMP4O75379 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
VAMP4O75379 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
VAMP4O75379 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
VAMP4O75379 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
VAMP4O75379 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
VAMP4O75379 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
VAMP4O75379 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
VAMP4O75379 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
VAMP4O75379 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
VAMP4O75379 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
VAMP4O75379 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
VAMP4O75379 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
VAMP4O75379 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
VAMP4O75379 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
VAMP4O75379 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
VAMP4O75379 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
VAMP4O75379 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
VAMP4O75379 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
VAMP4O75379 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
VAMP4O75379 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
VAMP4O75379 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
VAMP4O75379 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
VAMP4O75379 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
VAMP4O75379 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
VAMP4O75379 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
VAMP4O75379 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
VAMP4O75379 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
VAMP4O75379 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
VAMP4O75379 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
VAMP4O75379 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
VAMP4O75379 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
VAMP4O75379 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
VAMP4O75379 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
VAMP4O75379 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
VAMP4O75379 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
VAMP4O75379 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
VAMP4O75379 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
VAMP4O75379 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
VAMP4O75379 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
VAMP4O75379 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
VAMP4O75379 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
VAMP4O75379 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
VAMP4O75379 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
VAMP4O75379 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
VAMP4O75379 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
VAMP4O75379 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
VAMP4O75379 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
VAMP4O75379 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
VAMP4O75379 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
VAMP4O75379 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
VAMP4O75379 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
VAMP4O75379 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
VAMP4O75379 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
VAMP4O75379 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
VAMP4O75379 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
VAMP4O75379 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
VAMP4O75379 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
VAMP4O75379 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
VAMP4O75379 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
VAMP4O75379 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
VAMP4O75379 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
VAMP4O75379 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
VAMP4O75379 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
VAMP4O75379 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
VAMP4O75379 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
VAMP4O75379 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
VAMP4O75379 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
VAMP4O75379 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms