Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NIPSNAP2O75323 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NIPSNAP2O75323 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NIPSNAP2O75323 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NIPSNAP2O75323 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NIPSNAP2O75323 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NIPSNAP2O75323 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NIPSNAP2O75323 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NIPSNAP2O75323 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NIPSNAP2O75323 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NIPSNAP2O75323 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NIPSNAP2O75323 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NIPSNAP2O75323 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NIPSNAP2O75323 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NIPSNAP2O75323 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NIPSNAP2O75323 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NIPSNAP2O75323 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NIPSNAP2O75323 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NIPSNAP2O75323 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NIPSNAP2O75323 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NIPSNAP2O75323 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NIPSNAP2O75323 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NIPSNAP2O75323 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NIPSNAP2O75323 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NIPSNAP2O75323 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NIPSNAP2O75323 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NIPSNAP2O75323 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NIPSNAP2O75323 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NIPSNAP2O75323 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NIPSNAP2O75323 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NIPSNAP2O75323 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NIPSNAP2O75323 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NIPSNAP2O75323 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NIPSNAP2O75323 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NIPSNAP2O75323 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NIPSNAP2O75323 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NIPSNAP2O75323 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NIPSNAP2O75323 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NIPSNAP2O75323 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NIPSNAP2O75323 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NIPSNAP2O75323 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NIPSNAP2O75323 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NIPSNAP2O75323 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NIPSNAP2O75323 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NIPSNAP2O75323 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NIPSNAP2O75323 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NIPSNAP2O75323 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NIPSNAP2O75323 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NIPSNAP2O75323 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NIPSNAP2O75323 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NIPSNAP2O75323 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NIPSNAP2O75323 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NIPSNAP2O75323 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NIPSNAP2O75323 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NIPSNAP2O75323 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NIPSNAP2O75323 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NIPSNAP2O75323 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NIPSNAP2O75323 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NIPSNAP2O75323 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NIPSNAP2O75323 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NIPSNAP2O75323 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NIPSNAP2O75323 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NIPSNAP2O75323 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NIPSNAP2O75323 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NIPSNAP2O75323 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NIPSNAP2O75323 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NIPSNAP2O75323 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NIPSNAP2O75323 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NIPSNAP2O75323 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NIPSNAP2O75323 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NIPSNAP2O75323 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NIPSNAP2O75323 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NIPSNAP2O75323 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NIPSNAP2O75323 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIPSNAP2O75323 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIPSNAP2O75323 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIPSNAP2O75323 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIPSNAP2O75323 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIPSNAP2O75323 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIPSNAP2O75323 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NIPSNAP2O75323 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIPSNAP2O75323 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIPSNAP2O75323 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIPSNAP2O75323 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIPSNAP2O75323 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIPSNAP2O75323 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIPSNAP2O75323 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIPSNAP2O75323 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIPSNAP2O75323 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIPSNAP2O75323 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NIPSNAP2O75323 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIPSNAP2O75323 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIPSNAP2O75323 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIPSNAP2O75323 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIPSNAP2O75323 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIPSNAP2O75323 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIPSNAP2O75323 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NIPSNAP2O75323 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NIPSNAP2O75323 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NIPSNAP2O75323 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms