Protein–RNA interactions for Protein: O60749

SNX2, Sorting nexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX2O60749 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX2O60749 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX2O60749 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX2O60749 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX2O60749 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX2O60749 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX2O60749 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX2O60749 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX2O60749 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX2O60749 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX2O60749 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX2O60749 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX2O60749 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX2O60749 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX2O60749 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX2O60749 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX2O60749 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX2O60749 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX2O60749 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX2O60749 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX2O60749 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX2O60749 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX2O60749 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX2O60749 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX2O60749 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX2O60749 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX2O60749 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX2O60749 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX2O60749 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX2O60749 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX2O60749 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX2O60749 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX2O60749 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX2O60749 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX2O60749 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX2O60749 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX2O60749 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX2O60749 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX2O60749 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX2O60749 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX2O60749 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX2O60749 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX2O60749 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX2O60749 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX2O60749 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX2O60749 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX2O60749 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX2O60749 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX2O60749 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX2O60749 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX2O60749 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX2O60749 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX2O60749 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX2O60749 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX2O60749 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX2O60749 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX2O60749 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX2O60749 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX2O60749 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX2O60749 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX2O60749 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX2O60749 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX2O60749 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX2O60749 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX2O60749 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX2O60749 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX2O60749 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX2O60749 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX2O60749 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX2O60749 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX2O60749 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX2O60749 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX2O60749 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNX2O60749 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX2O60749 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX2O60749 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX2O60749 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX2O60749 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX2O60749 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX2O60749 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX2O60749 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX2O60749 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX2O60749 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX2O60749 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX2O60749 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX2O60749 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX2O60749 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX2O60749 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX2O60749 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX2O60749 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX2O60749 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX2O60749 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX2O60749 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX2O60749 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX2O60749 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX2O60749 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX2O60749 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX2O60749 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX2O60749 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX2O60749 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms