Protein–RNA interactions for Protein: O60716

CTNND1, Catenin delta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND1O60716 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTNND1O60716 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTNND1O60716 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTNND1O60716 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTNND1O60716 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTNND1O60716 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTNND1O60716 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTNND1O60716 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTNND1O60716 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTNND1O60716 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CTNND1O60716 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTNND1O60716 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTNND1O60716 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTNND1O60716 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTNND1O60716 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTNND1O60716 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTNND1O60716 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTNND1O60716 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTNND1O60716 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTNND1O60716 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTNND1O60716 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CTNND1O60716 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTNND1O60716 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTNND1O60716 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CTNND1O60716 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTNND1O60716 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTNND1O60716 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTNND1O60716 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTNND1O60716 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CTNND1O60716 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTNND1O60716 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CTNND1O60716 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTNND1O60716 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTNND1O60716 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTNND1O60716 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTNND1O60716 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CTNND1O60716 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTNND1O60716 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTNND1O60716 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTNND1O60716 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTNND1O60716 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CTNND1O60716 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTNND1O60716 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTNND1O60716 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CTNND1O60716 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTNND1O60716 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTNND1O60716 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTNND1O60716 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTNND1O60716 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTNND1O60716 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTNND1O60716 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTNND1O60716 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTNND1O60716 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTNND1O60716 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTNND1O60716 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTNND1O60716 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTNND1O60716 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTNND1O60716 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTNND1O60716 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTNND1O60716 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTNND1O60716 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTNND1O60716 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTNND1O60716 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTNND1O60716 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CTNND1O60716 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTNND1O60716 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTNND1O60716 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTNND1O60716 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTNND1O60716 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTNND1O60716 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTNND1O60716 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CTNND1O60716 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CTNND1O60716 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CTNND1O60716 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CTNND1O60716 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CTNND1O60716 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CTNND1O60716 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CTNND1O60716 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CTNND1O60716 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CTNND1O60716 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CTNND1O60716 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CTNND1O60716 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTNND1O60716 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTNND1O60716 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTNND1O60716 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTNND1O60716 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CTNND1O60716 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTNND1O60716 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTNND1O60716 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTNND1O60716 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CTNND1O60716 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CTNND1O60716 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CTNND1O60716 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTNND1O60716 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTNND1O60716 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTNND1O60716 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CTNND1O60716 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CTNND1O60716 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTNND1O60716 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTNND1O60716 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms