Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MSCO60682 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
MSCO60682 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MSCO60682 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MSCO60682 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MSCO60682 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MSCO60682 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MSCO60682 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MSCO60682 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
MSCO60682 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MSCO60682 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MSCO60682 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MSCO60682 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MSCO60682 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MSCO60682 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MSCO60682 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MSCO60682 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MSCO60682 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MSCO60682 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MSCO60682 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
MSCO60682 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MSCO60682 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MSCO60682 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MSCO60682 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MSCO60682 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MSCO60682 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MSCO60682 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MSCO60682 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MSCO60682 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MSCO60682 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MSCO60682 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MSCO60682 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MSCO60682 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MSCO60682 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
MSCO60682 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MSCO60682 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MSCO60682 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MSCO60682 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MSCO60682 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MSCO60682 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MSCO60682 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MSCO60682 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MSCO60682 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MSCO60682 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MSCO60682 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MSCO60682 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
MSCO60682 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MSCO60682 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MSCO60682 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MSCO60682 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MSCO60682 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MSCO60682 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MSCO60682 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MSCO60682 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MSCO60682 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MSCO60682 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
MSCO60682 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MSCO60682 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MSCO60682 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MSCO60682 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MSCO60682 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MSCO60682 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MSCO60682 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MSCO60682 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MSCO60682 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MSCO60682 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MSCO60682 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MSCO60682 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MSCO60682 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MSCO60682 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MSCO60682 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MSCO60682 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MSCO60682 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MSCO60682 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MSCO60682 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
MSCO60682 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MSCO60682 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MSCO60682 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MSCO60682 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MSCO60682 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MSCO60682 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MSCO60682 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MSCO60682 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MSCO60682 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MSCO60682 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MSCO60682 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MSCO60682 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MSCO60682 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MSCO60682 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
MSCO60682 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MSCO60682 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MSCO60682 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MSCO60682 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
MSCO60682 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
MSCO60682 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MSCO60682 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MSCO60682 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MSCO60682 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MSCO60682 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MSCO60682 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms