Protein–RNA interactions for Protein: O60548

FOXD2, Forkhead box protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD2O60548 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXD2O60548 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXD2O60548 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXD2O60548 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXD2O60548 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXD2O60548 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXD2O60548 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXD2O60548 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXD2O60548 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXD2O60548 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXD2O60548 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXD2O60548 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXD2O60548 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXD2O60548 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXD2O60548 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXD2O60548 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXD2O60548 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXD2O60548 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXD2O60548 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXD2O60548 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXD2O60548 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXD2O60548 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXD2O60548 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXD2O60548 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXD2O60548 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXD2O60548 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXD2O60548 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXD2O60548 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXD2O60548 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXD2O60548 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXD2O60548 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXD2O60548 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXD2O60548 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXD2O60548 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXD2O60548 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXD2O60548 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXD2O60548 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXD2O60548 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXD2O60548 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXD2O60548 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXD2O60548 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXD2O60548 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXD2O60548 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXD2O60548 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXD2O60548 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXD2O60548 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
FOXD2O60548 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FOXD2O60548 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FOXD2O60548 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FOXD2O60548 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FOXD2O60548 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXD2O60548 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXD2O60548 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXD2O60548 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXD2O60548 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXD2O60548 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXD2O60548 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXD2O60548 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXD2O60548 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXD2O60548 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXD2O60548 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXD2O60548 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXD2O60548 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXD2O60548 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXD2O60548 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXD2O60548 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXD2O60548 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXD2O60548 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXD2O60548 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXD2O60548 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXD2O60548 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXD2O60548 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXD2O60548 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXD2O60548 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXD2O60548 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXD2O60548 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXD2O60548 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXD2O60548 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXD2O60548 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXD2O60548 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXD2O60548 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXD2O60548 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXD2O60548 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXD2O60548 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD2O60548 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD2O60548 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD2O60548 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD2O60548 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD2O60548 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD2O60548 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD2O60548 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD2O60548 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD2O60548 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD2O60548 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD2O60548 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD2O60548 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD2O60548 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXD2O60548 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXD2O60548 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXD2O60548 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms