Protein–RNA interactions for Protein: O43900

PRICKLE3, Prickle planar cell polarity protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRICKLE3O43900 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRICKLE3O43900 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRICKLE3O43900 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRICKLE3O43900 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRICKLE3O43900 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRICKLE3O43900 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRICKLE3O43900 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRICKLE3O43900 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRICKLE3O43900 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRICKLE3O43900 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRICKLE3O43900 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRICKLE3O43900 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRICKLE3O43900 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRICKLE3O43900 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRICKLE3O43900 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRICKLE3O43900 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRICKLE3O43900 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRICKLE3O43900 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRICKLE3O43900 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRICKLE3O43900 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRICKLE3O43900 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRICKLE3O43900 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRICKLE3O43900 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRICKLE3O43900 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRICKLE3O43900 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRICKLE3O43900 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRICKLE3O43900 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRICKLE3O43900 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRICKLE3O43900 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRICKLE3O43900 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRICKLE3O43900 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRICKLE3O43900 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRICKLE3O43900 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRICKLE3O43900 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRICKLE3O43900 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRICKLE3O43900 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PRICKLE3O43900 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PRICKLE3O43900 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRICKLE3O43900 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRICKLE3O43900 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRICKLE3O43900 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRICKLE3O43900 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRICKLE3O43900 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRICKLE3O43900 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRICKLE3O43900 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRICKLE3O43900 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRICKLE3O43900 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRICKLE3O43900 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRICKLE3O43900 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRICKLE3O43900 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRICKLE3O43900 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRICKLE3O43900 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRICKLE3O43900 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRICKLE3O43900 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRICKLE3O43900 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRICKLE3O43900 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRICKLE3O43900 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRICKLE3O43900 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRICKLE3O43900 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRICKLE3O43900 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRICKLE3O43900 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRICKLE3O43900 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRICKLE3O43900 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRICKLE3O43900 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRICKLE3O43900 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRICKLE3O43900 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRICKLE3O43900 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRICKLE3O43900 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRICKLE3O43900 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRICKLE3O43900 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRICKLE3O43900 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRICKLE3O43900 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PRICKLE3O43900 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRICKLE3O43900 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRICKLE3O43900 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRICKLE3O43900 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRICKLE3O43900 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRICKLE3O43900 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRICKLE3O43900 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRICKLE3O43900 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PRICKLE3O43900 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRICKLE3O43900 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRICKLE3O43900 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRICKLE3O43900 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRICKLE3O43900 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRICKLE3O43900 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRICKLE3O43900 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRICKLE3O43900 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRICKLE3O43900 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRICKLE3O43900 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRICKLE3O43900 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRICKLE3O43900 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PRICKLE3O43900 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRICKLE3O43900 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PRICKLE3O43900 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRICKLE3O43900 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRICKLE3O43900 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRICKLE3O43900 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRICKLE3O43900 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRICKLE3O43900 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms