Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
EDIL3O43854 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EDIL3O43854 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
EDIL3O43854 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
EDIL3O43854 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
EDIL3O43854 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EDIL3O43854 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
EDIL3O43854 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EDIL3O43854 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EDIL3O43854 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EDIL3O43854 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EDIL3O43854 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EDIL3O43854 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EDIL3O43854 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EDIL3O43854 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EDIL3O43854 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
EDIL3O43854 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EDIL3O43854 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EDIL3O43854 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EDIL3O43854 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EDIL3O43854 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EDIL3O43854 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EDIL3O43854 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EDIL3O43854 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EDIL3O43854 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
EDIL3O43854 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EDIL3O43854 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EDIL3O43854 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EDIL3O43854 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EDIL3O43854 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EDIL3O43854 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EDIL3O43854 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EDIL3O43854 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EDIL3O43854 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EDIL3O43854 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EDIL3O43854 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EDIL3O43854 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EDIL3O43854 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EDIL3O43854 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EDIL3O43854 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EDIL3O43854 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EDIL3O43854 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EDIL3O43854 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EDIL3O43854 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EDIL3O43854 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EDIL3O43854 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EDIL3O43854 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EDIL3O43854 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EDIL3O43854 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EDIL3O43854 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EDIL3O43854 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EDIL3O43854 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EDIL3O43854 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EDIL3O43854 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EDIL3O43854 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EDIL3O43854 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EDIL3O43854 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EDIL3O43854 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EDIL3O43854 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EDIL3O43854 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EDIL3O43854 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EDIL3O43854 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EDIL3O43854 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EDIL3O43854 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EDIL3O43854 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
EDIL3O43854 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EDIL3O43854 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EDIL3O43854 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EDIL3O43854 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EDIL3O43854 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EDIL3O43854 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EDIL3O43854 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EDIL3O43854 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EDIL3O43854 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EDIL3O43854 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EDIL3O43854 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EDIL3O43854 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EDIL3O43854 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EDIL3O43854 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EDIL3O43854 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EDIL3O43854 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EDIL3O43854 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EDIL3O43854 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EDIL3O43854 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EDIL3O43854 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EDIL3O43854 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EDIL3O43854 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EDIL3O43854 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EDIL3O43854 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EDIL3O43854 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EDIL3O43854 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EDIL3O43854 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EDIL3O43854 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
EDIL3O43854 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EDIL3O43854 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EDIL3O43854 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EDIL3O43854 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EDIL3O43854 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EDIL3O43854 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EDIL3O43854 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms