Protein–RNA interactions for Protein: O43813

LANCL1, LanC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LANCL1O43813 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LANCL1O43813 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LANCL1O43813 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LANCL1O43813 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LANCL1O43813 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
LANCL1O43813 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
LANCL1O43813 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
LANCL1O43813 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
LANCL1O43813 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
LANCL1O43813 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
LANCL1O43813 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
LANCL1O43813 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
LANCL1O43813 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
LANCL1O43813 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
LANCL1O43813 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
LANCL1O43813 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
LANCL1O43813 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
LANCL1O43813 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LANCL1O43813 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LANCL1O43813 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LANCL1O43813 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LANCL1O43813 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LANCL1O43813 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LANCL1O43813 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LANCL1O43813 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LANCL1O43813 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LANCL1O43813 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LANCL1O43813 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LANCL1O43813 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LANCL1O43813 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LANCL1O43813 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LANCL1O43813 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LANCL1O43813 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LANCL1O43813 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LANCL1O43813 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LANCL1O43813 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LANCL1O43813 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
LANCL1O43813 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LANCL1O43813 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LANCL1O43813 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LANCL1O43813 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LANCL1O43813 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
LANCL1O43813 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LANCL1O43813 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LANCL1O43813 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LANCL1O43813 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LANCL1O43813 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LANCL1O43813 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LANCL1O43813 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LANCL1O43813 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LANCL1O43813 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LANCL1O43813 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LANCL1O43813 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LANCL1O43813 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LANCL1O43813 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LANCL1O43813 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LANCL1O43813 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LANCL1O43813 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LANCL1O43813 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LANCL1O43813 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LANCL1O43813 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LANCL1O43813 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LANCL1O43813 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LANCL1O43813 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LANCL1O43813 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LANCL1O43813 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LANCL1O43813 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LANCL1O43813 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LANCL1O43813 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LANCL1O43813 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LANCL1O43813 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LANCL1O43813 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LANCL1O43813 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LANCL1O43813 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LANCL1O43813 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LANCL1O43813 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
LANCL1O43813 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LANCL1O43813 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LANCL1O43813 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LANCL1O43813 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LANCL1O43813 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LANCL1O43813 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LANCL1O43813 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LANCL1O43813 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LANCL1O43813 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LANCL1O43813 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LANCL1O43813 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LANCL1O43813 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LANCL1O43813 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LANCL1O43813 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LANCL1O43813 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LANCL1O43813 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LANCL1O43813 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LANCL1O43813 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LANCL1O43813 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LANCL1O43813 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LANCL1O43813 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
LANCL1O43813 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LANCL1O43813 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LANCL1O43813 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms