Protein–RNA interactions for Protein: O43657

TSPAN6, Tetraspanin-6, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN6O43657 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSPAN6O43657 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TSPAN6O43657 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSPAN6O43657 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSPAN6O43657 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSPAN6O43657 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TSPAN6O43657 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TSPAN6O43657 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSPAN6O43657 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSPAN6O43657 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSPAN6O43657 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSPAN6O43657 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSPAN6O43657 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSPAN6O43657 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSPAN6O43657 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TSPAN6O43657 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSPAN6O43657 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSPAN6O43657 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSPAN6O43657 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSPAN6O43657 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TSPAN6O43657 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSPAN6O43657 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSPAN6O43657 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSPAN6O43657 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSPAN6O43657 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSPAN6O43657 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSPAN6O43657 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TSPAN6O43657 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSPAN6O43657 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSPAN6O43657 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TSPAN6O43657 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TSPAN6O43657 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TSPAN6O43657 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSPAN6O43657 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSPAN6O43657 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TSPAN6O43657 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSPAN6O43657 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TSPAN6O43657 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSPAN6O43657 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TSPAN6O43657 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSPAN6O43657 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSPAN6O43657 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSPAN6O43657 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSPAN6O43657 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TSPAN6O43657 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSPAN6O43657 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TSPAN6O43657 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSPAN6O43657 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSPAN6O43657 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSPAN6O43657 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSPAN6O43657 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSPAN6O43657 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSPAN6O43657 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSPAN6O43657 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSPAN6O43657 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSPAN6O43657 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSPAN6O43657 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSPAN6O43657 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSPAN6O43657 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSPAN6O43657 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSPAN6O43657 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSPAN6O43657 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSPAN6O43657 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TSPAN6O43657 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSPAN6O43657 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSPAN6O43657 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSPAN6O43657 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSPAN6O43657 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSPAN6O43657 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSPAN6O43657 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSPAN6O43657 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSPAN6O43657 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSPAN6O43657 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSPAN6O43657 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSPAN6O43657 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TSPAN6O43657 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSPAN6O43657 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSPAN6O43657 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSPAN6O43657 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSPAN6O43657 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSPAN6O43657 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TSPAN6O43657 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSPAN6O43657 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSPAN6O43657 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSPAN6O43657 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSPAN6O43657 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSPAN6O43657 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSPAN6O43657 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSPAN6O43657 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSPAN6O43657 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSPAN6O43657 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSPAN6O43657 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSPAN6O43657 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TSPAN6O43657 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSPAN6O43657 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSPAN6O43657 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSPAN6O43657 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSPAN6O43657 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSPAN6O43657 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSPAN6O43657 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms