Protein–RNA interactions for Protein: O43502

RAD51C, DNA repair protein RAD51 homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51CO43502 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD51CO43502 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD51CO43502 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD51CO43502 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD51CO43502 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD51CO43502 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD51CO43502 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD51CO43502 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD51CO43502 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD51CO43502 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD51CO43502 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD51CO43502 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD51CO43502 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD51CO43502 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD51CO43502 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD51CO43502 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD51CO43502 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD51CO43502 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD51CO43502 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD51CO43502 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD51CO43502 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD51CO43502 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD51CO43502 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD51CO43502 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD51CO43502 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAD51CO43502 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAD51CO43502 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RAD51CO43502 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD51CO43502 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD51CO43502 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD51CO43502 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD51CO43502 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD51CO43502 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD51CO43502 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAD51CO43502 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAD51CO43502 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAD51CO43502 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAD51CO43502 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD51CO43502 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD51CO43502 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD51CO43502 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD51CO43502 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD51CO43502 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD51CO43502 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD51CO43502 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD51CO43502 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD51CO43502 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD51CO43502 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD51CO43502 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD51CO43502 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD51CO43502 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD51CO43502 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD51CO43502 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD51CO43502 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD51CO43502 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD51CO43502 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD51CO43502 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD51CO43502 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD51CO43502 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD51CO43502 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD51CO43502 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD51CO43502 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD51CO43502 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD51CO43502 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD51CO43502 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD51CO43502 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD51CO43502 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD51CO43502 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD51CO43502 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD51CO43502 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD51CO43502 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD51CO43502 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD51CO43502 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD51CO43502 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD51CO43502 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAD51CO43502 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAD51CO43502 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAD51CO43502 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAD51CO43502 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAD51CO43502 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAD51CO43502 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAD51CO43502 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAD51CO43502 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD51CO43502 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD51CO43502 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD51CO43502 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD51CO43502 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD51CO43502 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD51CO43502 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD51CO43502 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD51CO43502 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD51CO43502 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD51CO43502 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD51CO43502 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAD51CO43502 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAD51CO43502 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAD51CO43502 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAD51CO43502 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAD51CO43502 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD51CO43502 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms