Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTSS1O43312 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTSS1O43312 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTSS1O43312 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MTSS1O43312 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTSS1O43312 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTSS1O43312 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTSS1O43312 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTSS1O43312 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTSS1O43312 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTSS1O43312 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTSS1O43312 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTSS1O43312 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTSS1O43312 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTSS1O43312 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTSS1O43312 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTSS1O43312 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MTSS1O43312 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MTSS1O43312 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTSS1O43312 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MTSS1O43312 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MTSS1O43312 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MTSS1O43312 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTSS1O43312 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTSS1O43312 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTSS1O43312 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTSS1O43312 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTSS1O43312 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MTSS1O43312 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTSS1O43312 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTSS1O43312 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTSS1O43312 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTSS1O43312 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTSS1O43312 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTSS1O43312 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MTSS1O43312 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTSS1O43312 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTSS1O43312 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTSS1O43312 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTSS1O43312 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTSS1O43312 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MTSS1O43312 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTSS1O43312 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTSS1O43312 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTSS1O43312 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTSS1O43312 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTSS1O43312 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTSS1O43312 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTSS1O43312 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTSS1O43312 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTSS1O43312 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MTSS1O43312 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTSS1O43312 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTSS1O43312 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTSS1O43312 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTSS1O43312 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTSS1O43312 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTSS1O43312 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTSS1O43312 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTSS1O43312 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTSS1O43312 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTSS1O43312 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTSS1O43312 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTSS1O43312 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTSS1O43312 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTSS1O43312 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTSS1O43312 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTSS1O43312 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTSS1O43312 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTSS1O43312 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTSS1O43312 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTSS1O43312 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTSS1O43312 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTSS1O43312 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MTSS1O43312 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MTSS1O43312 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
MTSS1O43312 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MTSS1O43312 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MTSS1O43312 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MTSS1O43312 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTSS1O43312 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTSS1O43312 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTSS1O43312 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTSS1O43312 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTSS1O43312 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTSS1O43312 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTSS1O43312 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTSS1O43312 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTSS1O43312 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTSS1O43312 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTSS1O43312 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MTSS1O43312 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MTSS1O43312 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MTSS1O43312 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MTSS1O43312 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MTSS1O43312 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MTSS1O43312 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MTSS1O43312 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MTSS1O43312 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MTSS1O43312 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms