Protein–RNA interactions for Protein: O43159

RRP8, Ribosomal RNA-processing protein 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP8O43159 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRP8O43159 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RRP8O43159 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRP8O43159 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRP8O43159 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRP8O43159 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRP8O43159 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRP8O43159 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRP8O43159 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRP8O43159 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRP8O43159 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRP8O43159 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRP8O43159 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRP8O43159 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RRP8O43159 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RRP8O43159 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRP8O43159 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRP8O43159 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRP8O43159 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RRP8O43159 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRP8O43159 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRP8O43159 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRP8O43159 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRP8O43159 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRP8O43159 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRP8O43159 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRP8O43159 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRP8O43159 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRP8O43159 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRP8O43159 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRP8O43159 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RRP8O43159 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RRP8O43159 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRP8O43159 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRP8O43159 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRP8O43159 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRP8O43159 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRP8O43159 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRP8O43159 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRP8O43159 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRP8O43159 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRP8O43159 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRP8O43159 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RRP8O43159 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRP8O43159 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRP8O43159 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRP8O43159 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRP8O43159 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRP8O43159 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRP8O43159 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRP8O43159 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRP8O43159 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRP8O43159 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRP8O43159 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRP8O43159 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP8O43159 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP8O43159 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP8O43159 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP8O43159 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP8O43159 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP8O43159 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP8O43159 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP8O43159 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP8O43159 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRP8O43159 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRP8O43159 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRP8O43159 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRP8O43159 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRP8O43159 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRP8O43159 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRP8O43159 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RRP8O43159 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRP8O43159 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRP8O43159 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRP8O43159 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRP8O43159 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRP8O43159 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRP8O43159 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRP8O43159 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRP8O43159 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRP8O43159 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RRP8O43159 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRP8O43159 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRP8O43159 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRP8O43159 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRP8O43159 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRP8O43159 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRP8O43159 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RRP8O43159 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRP8O43159 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRP8O43159 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRP8O43159 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRP8O43159 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRP8O43159 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRP8O43159 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRP8O43159 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRP8O43159 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRP8O43159 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRP8O43159 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRP8O43159 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms