Protein–RNA interactions for Protein: O15270

SPTLC2, Serine palmitoyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC2O15270 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPTLC2O15270 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPTLC2O15270 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPTLC2O15270 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPTLC2O15270 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPTLC2O15270 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPTLC2O15270 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPTLC2O15270 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPTLC2O15270 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPTLC2O15270 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPTLC2O15270 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPTLC2O15270 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPTLC2O15270 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPTLC2O15270 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPTLC2O15270 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SPTLC2O15270 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SPTLC2O15270 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SPTLC2O15270 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SPTLC2O15270 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SPTLC2O15270 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SPTLC2O15270 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPTLC2O15270 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPTLC2O15270 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SPTLC2O15270 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPTLC2O15270 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPTLC2O15270 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPTLC2O15270 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPTLC2O15270 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPTLC2O15270 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPTLC2O15270 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPTLC2O15270 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPTLC2O15270 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPTLC2O15270 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SPTLC2O15270 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPTLC2O15270 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPTLC2O15270 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPTLC2O15270 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPTLC2O15270 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPTLC2O15270 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPTLC2O15270 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPTLC2O15270 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPTLC2O15270 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPTLC2O15270 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPTLC2O15270 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPTLC2O15270 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPTLC2O15270 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPTLC2O15270 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPTLC2O15270 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPTLC2O15270 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPTLC2O15270 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPTLC2O15270 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPTLC2O15270 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPTLC2O15270 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SPTLC2O15270 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPTLC2O15270 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPTLC2O15270 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPTLC2O15270 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPTLC2O15270 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPTLC2O15270 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPTLC2O15270 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPTLC2O15270 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPTLC2O15270 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPTLC2O15270 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPTLC2O15270 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPTLC2O15270 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPTLC2O15270 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPTLC2O15270 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPTLC2O15270 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPTLC2O15270 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPTLC2O15270 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPTLC2O15270 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SPTLC2O15270 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SPTLC2O15270 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPTLC2O15270 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPTLC2O15270 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPTLC2O15270 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SPTLC2O15270 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPTLC2O15270 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SPTLC2O15270 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPTLC2O15270 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPTLC2O15270 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPTLC2O15270 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPTLC2O15270 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPTLC2O15270 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPTLC2O15270 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPTLC2O15270 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPTLC2O15270 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPTLC2O15270 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPTLC2O15270 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPTLC2O15270 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPTLC2O15270 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPTLC2O15270 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPTLC2O15270 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SPTLC2O15270 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPTLC2O15270 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SPTLC2O15270 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPTLC2O15270 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPTLC2O15270 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPTLC2O15270 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPTLC2O15270 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms