Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBDO15205 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBDO15205 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
UBDO15205 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBDO15205 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBDO15205 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBDO15205 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBDO15205 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBDO15205 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBDO15205 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBDO15205 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBDO15205 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBDO15205 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBDO15205 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBDO15205 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBDO15205 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBDO15205 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBDO15205 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBDO15205 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBDO15205 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBDO15205 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBDO15205 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBDO15205 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBDO15205 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBDO15205 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBDO15205 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
UBDO15205 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBDO15205 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBDO15205 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBDO15205 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBDO15205 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBDO15205 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBDO15205 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBDO15205 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBDO15205 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBDO15205 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBDO15205 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBDO15205 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBDO15205 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBDO15205 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBDO15205 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBDO15205 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBDO15205 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBDO15205 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBDO15205 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBDO15205 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBDO15205 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBDO15205 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBDO15205 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBDO15205 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBDO15205 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBDO15205 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBDO15205 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
UBDO15205 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBDO15205 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBDO15205 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBDO15205 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBDO15205 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBDO15205 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBDO15205 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBDO15205 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBDO15205 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBDO15205 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBDO15205 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBDO15205 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBDO15205 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBDO15205 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBDO15205 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBDO15205 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
UBDO15205 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBDO15205 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBDO15205 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBDO15205 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBDO15205 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBDO15205 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBDO15205 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBDO15205 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
UBDO15205 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBDO15205 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBDO15205 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBDO15205 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBDO15205 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBDO15205 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBDO15205 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBDO15205 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBDO15205 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBDO15205 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBDO15205 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
UBDO15205 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBDO15205 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBDO15205 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBDO15205 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBDO15205 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBDO15205 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBDO15205 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBDO15205 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBDO15205 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
UBDO15205 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBDO15205 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
UBDO15205 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms