Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARPC1BO15143 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARPC1BO15143 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARPC1BO15143 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARPC1BO15143 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARPC1BO15143 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARPC1BO15143 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARPC1BO15143 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARPC1BO15143 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARPC1BO15143 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARPC1BO15143 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARPC1BO15143 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARPC1BO15143 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARPC1BO15143 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARPC1BO15143 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ARPC1BO15143 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARPC1BO15143 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARPC1BO15143 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARPC1BO15143 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARPC1BO15143 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ARPC1BO15143 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARPC1BO15143 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARPC1BO15143 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARPC1BO15143 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARPC1BO15143 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARPC1BO15143 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARPC1BO15143 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARPC1BO15143 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARPC1BO15143 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARPC1BO15143 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARPC1BO15143 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARPC1BO15143 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARPC1BO15143 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARPC1BO15143 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARPC1BO15143 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARPC1BO15143 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARPC1BO15143 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARPC1BO15143 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARPC1BO15143 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARPC1BO15143 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ARPC1BO15143 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARPC1BO15143 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARPC1BO15143 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARPC1BO15143 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARPC1BO15143 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ARPC1BO15143 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARPC1BO15143 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARPC1BO15143 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARPC1BO15143 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARPC1BO15143 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARPC1BO15143 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARPC1BO15143 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARPC1BO15143 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARPC1BO15143 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARPC1BO15143 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARPC1BO15143 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARPC1BO15143 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARPC1BO15143 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARPC1BO15143 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARPC1BO15143 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARPC1BO15143 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARPC1BO15143 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARPC1BO15143 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARPC1BO15143 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARPC1BO15143 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARPC1BO15143 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARPC1BO15143 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARPC1BO15143 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARPC1BO15143 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARPC1BO15143 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARPC1BO15143 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARPC1BO15143 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARPC1BO15143 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARPC1BO15143 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARPC1BO15143 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARPC1BO15143 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARPC1BO15143 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARPC1BO15143 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARPC1BO15143 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARPC1BO15143 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARPC1BO15143 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARPC1BO15143 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARPC1BO15143 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARPC1BO15143 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ARPC1BO15143 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ARPC1BO15143 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARPC1BO15143 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARPC1BO15143 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARPC1BO15143 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARPC1BO15143 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARPC1BO15143 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARPC1BO15143 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARPC1BO15143 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ARPC1BO15143 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARPC1BO15143 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARPC1BO15143 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARPC1BO15143 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARPC1BO15143 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARPC1BO15143 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARPC1BO15143 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms