Protein–RNA interactions for Protein: O14896

IRF6, Interferon regulatory factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF6O14896 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IRF6O14896 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IRF6O14896 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IRF6O14896 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IRF6O14896 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
IRF6O14896 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
IRF6O14896 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IRF6O14896 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
IRF6O14896 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
IRF6O14896 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IRF6O14896 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IRF6O14896 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
IRF6O14896 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
IRF6O14896 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
IRF6O14896 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
IRF6O14896 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
IRF6O14896 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
IRF6O14896 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
IRF6O14896 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
IRF6O14896 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
IRF6O14896 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IRF6O14896 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
IRF6O14896 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
IRF6O14896 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
IRF6O14896 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
IRF6O14896 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
IRF6O14896 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
IRF6O14896 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
IRF6O14896 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
IRF6O14896 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
IRF6O14896 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
IRF6O14896 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
IRF6O14896 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
IRF6O14896 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
IRF6O14896 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
IRF6O14896 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
IRF6O14896 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
IRF6O14896 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
IRF6O14896 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
IRF6O14896 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
IRF6O14896 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
IRF6O14896 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
IRF6O14896 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
IRF6O14896 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
IRF6O14896 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
IRF6O14896 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
IRF6O14896 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
IRF6O14896 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IRF6O14896 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IRF6O14896 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IRF6O14896 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IRF6O14896 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
IRF6O14896 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
IRF6O14896 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
IRF6O14896 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
IRF6O14896 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
IRF6O14896 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IRF6O14896 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
IRF6O14896 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
IRF6O14896 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
IRF6O14896 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IRF6O14896 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
IRF6O14896 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
IRF6O14896 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
IRF6O14896 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IRF6O14896 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IRF6O14896 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IRF6O14896 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
IRF6O14896 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
IRF6O14896 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
IRF6O14896 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
IRF6O14896 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IRF6O14896 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IRF6O14896 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IRF6O14896 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
IRF6O14896 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IRF6O14896 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
IRF6O14896 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
IRF6O14896 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IRF6O14896 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IRF6O14896 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
IRF6O14896 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
IRF6O14896 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.57■■■□□ 2
IRF6O14896 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IRF6O14896 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IRF6O14896 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IRF6O14896 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IRF6O14896 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IRF6O14896 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
IRF6O14896 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
IRF6O14896 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.55■■■□□ 2
IRF6O14896 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IRF6O14896 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IRF6O14896 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IRF6O14896 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.54■■■□□ 2
IRF6O14896 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IRF6O14896 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.54■■■□□ 2
IRF6O14896 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IRF6O14896 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IRF6O14896 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.6 ms