Protein–RNA interactions for Protein: O14579

COPE, Coatomer subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPEO14579 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COPEO14579 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COPEO14579 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COPEO14579 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COPEO14579 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COPEO14579 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COPEO14579 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COPEO14579 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COPEO14579 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COPEO14579 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
COPEO14579 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COPEO14579 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COPEO14579 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COPEO14579 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPEO14579 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPEO14579 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPEO14579 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPEO14579 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPEO14579 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPEO14579 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPEO14579 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPEO14579 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPEO14579 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
COPEO14579 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPEO14579 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPEO14579 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPEO14579 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPEO14579 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPEO14579 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COPEO14579 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COPEO14579 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COPEO14579 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COPEO14579 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COPEO14579 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COPEO14579 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPEO14579 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPEO14579 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPEO14579 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPEO14579 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
COPEO14579 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPEO14579 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPEO14579 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPEO14579 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPEO14579 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPEO14579 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPEO14579 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPEO14579 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPEO14579 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPEO14579 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPEO14579 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPEO14579 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPEO14579 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPEO14579 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPEO14579 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPEO14579 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPEO14579 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPEO14579 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPEO14579 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPEO14579 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPEO14579 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPEO14579 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPEO14579 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPEO14579 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
COPEO14579 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
COPEO14579 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
COPEO14579 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
COPEO14579 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
COPEO14579 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
COPEO14579 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPEO14579 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPEO14579 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPEO14579 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPEO14579 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPEO14579 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPEO14579 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPEO14579 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPEO14579 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPEO14579 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPEO14579 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPEO14579 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPEO14579 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPEO14579 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPEO14579 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPEO14579 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPEO14579 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
COPEO14579 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPEO14579 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPEO14579 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPEO14579 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPEO14579 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPEO14579 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPEO14579 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPEO14579 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPEO14579 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPEO14579 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPEO14579 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPEO14579 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPEO14579 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPEO14579 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPEO14579 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms