Protein–RNA interactions for Protein: O00562

PITPNM1, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNM1O00562 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PITPNM1O00562 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PITPNM1O00562 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PITPNM1O00562 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PITPNM1O00562 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PITPNM1O00562 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PITPNM1O00562 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PITPNM1O00562 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PITPNM1O00562 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PITPNM1O00562 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PITPNM1O00562 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PITPNM1O00562 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PITPNM1O00562 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PITPNM1O00562 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PITPNM1O00562 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PITPNM1O00562 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PITPNM1O00562 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PITPNM1O00562 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PITPNM1O00562 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
PITPNM1O00562 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PITPNM1O00562 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PITPNM1O00562 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PITPNM1O00562 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PITPNM1O00562 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PITPNM1O00562 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PITPNM1O00562 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PITPNM1O00562 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PITPNM1O00562 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PITPNM1O00562 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PITPNM1O00562 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PITPNM1O00562 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PITPNM1O00562 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PITPNM1O00562 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PITPNM1O00562 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PITPNM1O00562 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PITPNM1O00562 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PITPNM1O00562 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PITPNM1O00562 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PITPNM1O00562 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PITPNM1O00562 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PITPNM1O00562 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PITPNM1O00562 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PITPNM1O00562 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PITPNM1O00562 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PITPNM1O00562 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PITPNM1O00562 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PITPNM1O00562 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PITPNM1O00562 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PITPNM1O00562 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PITPNM1O00562 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PITPNM1O00562 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PITPNM1O00562 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PITPNM1O00562 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PITPNM1O00562 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PITPNM1O00562 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PITPNM1O00562 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PITPNM1O00562 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PITPNM1O00562 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PITPNM1O00562 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PITPNM1O00562 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PITPNM1O00562 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PITPNM1O00562 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PITPNM1O00562 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PITPNM1O00562 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PITPNM1O00562 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PITPNM1O00562 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PITPNM1O00562 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PITPNM1O00562 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PITPNM1O00562 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PITPNM1O00562 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PITPNM1O00562 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PITPNM1O00562 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PITPNM1O00562 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PITPNM1O00562 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PITPNM1O00562 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PITPNM1O00562 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PITPNM1O00562 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PITPNM1O00562 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PITPNM1O00562 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PITPNM1O00562 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PITPNM1O00562 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PITPNM1O00562 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PITPNM1O00562 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PITPNM1O00562 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PITPNM1O00562 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PITPNM1O00562 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PITPNM1O00562 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PITPNM1O00562 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PITPNM1O00562 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PITPNM1O00562 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PITPNM1O00562 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PITPNM1O00562 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PITPNM1O00562 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PITPNM1O00562 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PITPNM1O00562 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PITPNM1O00562 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PITPNM1O00562 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PITPNM1O00562 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PITPNM1O00562 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PITPNM1O00562 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms