Protein–RNA interactions for Protein: O00339

MATN2, Matrilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN2O00339 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MATN2O00339 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MATN2O00339 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MATN2O00339 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MATN2O00339 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MATN2O00339 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MATN2O00339 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MATN2O00339 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MATN2O00339 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MATN2O00339 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MATN2O00339 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MATN2O00339 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MATN2O00339 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MATN2O00339 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MATN2O00339 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MATN2O00339 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MATN2O00339 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MATN2O00339 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MATN2O00339 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MATN2O00339 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MATN2O00339 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MATN2O00339 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MATN2O00339 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MATN2O00339 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MATN2O00339 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MATN2O00339 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MATN2O00339 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MATN2O00339 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MATN2O00339 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MATN2O00339 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MATN2O00339 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MATN2O00339 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MATN2O00339 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MATN2O00339 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MATN2O00339 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MATN2O00339 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MATN2O00339 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MATN2O00339 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MATN2O00339 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MATN2O00339 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MATN2O00339 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MATN2O00339 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MATN2O00339 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MATN2O00339 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MATN2O00339 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MATN2O00339 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MATN2O00339 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MATN2O00339 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MATN2O00339 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MATN2O00339 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MATN2O00339 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MATN2O00339 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MATN2O00339 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MATN2O00339 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MATN2O00339 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MATN2O00339 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MATN2O00339 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MATN2O00339 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MATN2O00339 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MATN2O00339 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MATN2O00339 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MATN2O00339 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MATN2O00339 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MATN2O00339 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MATN2O00339 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MATN2O00339 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MATN2O00339 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MATN2O00339 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MATN2O00339 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MATN2O00339 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MATN2O00339 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MATN2O00339 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MATN2O00339 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MATN2O00339 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MATN2O00339 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MATN2O00339 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MATN2O00339 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MATN2O00339 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MATN2O00339 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MATN2O00339 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MATN2O00339 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MATN2O00339 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MATN2O00339 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MATN2O00339 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MATN2O00339 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MATN2O00339 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MATN2O00339 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MATN2O00339 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MATN2O00339 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MATN2O00339 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MATN2O00339 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MATN2O00339 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MATN2O00339 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MATN2O00339 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MATN2O00339 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MATN2O00339 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MATN2O00339 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MATN2O00339 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MATN2O00339 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MATN2O00339 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms