Protein–RNA interactions for Protein: O00308

WWP2, NEDD4-like E3 ubiquitin-protein ligase WWP2, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WWP2O00308 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WWP2O00308 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
WWP2O00308 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
WWP2O00308 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
WWP2O00308 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WWP2O00308 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
WWP2O00308 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
WWP2O00308 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
WWP2O00308 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
WWP2O00308 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
WWP2O00308 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WWP2O00308 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WWP2O00308 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WWP2O00308 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WWP2O00308 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
WWP2O00308 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WWP2O00308 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WWP2O00308 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WWP2O00308 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WWP2O00308 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WWP2O00308 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WWP2O00308 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WWP2O00308 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WWP2O00308 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WWP2O00308 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WWP2O00308 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WWP2O00308 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WWP2O00308 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WWP2O00308 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WWP2O00308 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WWP2O00308 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
WWP2O00308 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WWP2O00308 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WWP2O00308 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WWP2O00308 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WWP2O00308 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WWP2O00308 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WWP2O00308 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WWP2O00308 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WWP2O00308 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WWP2O00308 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WWP2O00308 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WWP2O00308 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WWP2O00308 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WWP2O00308 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WWP2O00308 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WWP2O00308 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
WWP2O00308 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WWP2O00308 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WWP2O00308 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WWP2O00308 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WWP2O00308 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WWP2O00308 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WWP2O00308 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WWP2O00308 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WWP2O00308 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WWP2O00308 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WWP2O00308 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WWP2O00308 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WWP2O00308 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WWP2O00308 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WWP2O00308 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WWP2O00308 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WWP2O00308 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WWP2O00308 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
WWP2O00308 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WWP2O00308 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WWP2O00308 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WWP2O00308 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
WWP2O00308 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WWP2O00308 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WWP2O00308 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WWP2O00308 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
WWP2O00308 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WWP2O00308 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WWP2O00308 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WWP2O00308 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WWP2O00308 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
WWP2O00308 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WWP2O00308 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
WWP2O00308 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WWP2O00308 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
WWP2O00308 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
WWP2O00308 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
WWP2O00308 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
WWP2O00308 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WWP2O00308 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WWP2O00308 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WWP2O00308 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WWP2O00308 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WWP2O00308 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
WWP2O00308 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
WWP2O00308 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WWP2O00308 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WWP2O00308 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
WWP2O00308 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WWP2O00308 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WWP2O00308 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WWP2O00308 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
WWP2O00308 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms