Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RFXAPO00287 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFXAPO00287 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RFXAPO00287 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RFXAPO00287 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RFXAPO00287 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RFXAPO00287 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFXAPO00287 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFXAPO00287 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RFXAPO00287 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFXAPO00287 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFXAPO00287 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFXAPO00287 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RFXAPO00287 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFXAPO00287 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFXAPO00287 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RFXAPO00287 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RFXAPO00287 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RFXAPO00287 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RFXAPO00287 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RFXAPO00287 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RFXAPO00287 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RFXAPO00287 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RFXAPO00287 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RFXAPO00287 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RFXAPO00287 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RFXAPO00287 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RFXAPO00287 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RFXAPO00287 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RFXAPO00287 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RFXAPO00287 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RFXAPO00287 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RFXAPO00287 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RFXAPO00287 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RFXAPO00287 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RFXAPO00287 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RFXAPO00287 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RFXAPO00287 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RFXAPO00287 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RFXAPO00287 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RFXAPO00287 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RFXAPO00287 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RFXAPO00287 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RFXAPO00287 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFXAPO00287 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFXAPO00287 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFXAPO00287 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFXAPO00287 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFXAPO00287 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFXAPO00287 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFXAPO00287 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RFXAPO00287 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFXAPO00287 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFXAPO00287 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFXAPO00287 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFXAPO00287 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFXAPO00287 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFXAPO00287 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFXAPO00287 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RFXAPO00287 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFXAPO00287 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFXAPO00287 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RFXAPO00287 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RFXAPO00287 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RFXAPO00287 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RFXAPO00287 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RFXAPO00287 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RFXAPO00287 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFXAPO00287 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFXAPO00287 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFXAPO00287 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RFXAPO00287 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RFXAPO00287 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFXAPO00287 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RFXAPO00287 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RFXAPO00287 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RFXAPO00287 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RFXAPO00287 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RFXAPO00287 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RFXAPO00287 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RFXAPO00287 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RFXAPO00287 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RFXAPO00287 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RFXAPO00287 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RFXAPO00287 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RFXAPO00287 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RFXAPO00287 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RFXAPO00287 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RFXAPO00287 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RFXAPO00287 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RFXAPO00287 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RFXAPO00287 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RFXAPO00287 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RFXAPO00287 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFXAPO00287 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFXAPO00287 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFXAPO00287 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFXAPO00287 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFXAPO00287 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFXAPO00287 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms