Protein–RNA interactions for Protein: O00268

TAF4, Transcription initiation factor TFIID subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4O00268 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF4O00268 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF4O00268 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF4O00268 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF4O00268 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF4O00268 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF4O00268 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF4O00268 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TAF4O00268 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAF4O00268 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAF4O00268 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAF4O00268 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAF4O00268 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAF4O00268 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAF4O00268 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAF4O00268 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAF4O00268 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAF4O00268 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAF4O00268 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF4O00268 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF4O00268 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF4O00268 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF4O00268 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF4O00268 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF4O00268 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF4O00268 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF4O00268 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF4O00268 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF4O00268 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF4O00268 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF4O00268 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF4O00268 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF4O00268 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF4O00268 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF4O00268 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF4O00268 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF4O00268 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF4O00268 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF4O00268 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF4O00268 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF4O00268 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF4O00268 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF4O00268 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF4O00268 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF4O00268 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF4O00268 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF4O00268 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF4O00268 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF4O00268 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF4O00268 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF4O00268 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF4O00268 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF4O00268 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF4O00268 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF4O00268 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF4O00268 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF4O00268 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF4O00268 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF4O00268 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF4O00268 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF4O00268 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF4O00268 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF4O00268 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF4O00268 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TAF4O00268 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TAF4O00268 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TAF4O00268 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TAF4O00268 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TAF4O00268 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TAF4O00268 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TAF4O00268 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TAF4O00268 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF4O00268 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF4O00268 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF4O00268 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF4O00268 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF4O00268 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF4O00268 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF4O00268 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF4O00268 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF4O00268 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF4O00268 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF4O00268 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF4O00268 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF4O00268 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF4O00268 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF4O00268 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF4O00268 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF4O00268 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF4O00268 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF4O00268 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF4O00268 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF4O00268 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF4O00268 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF4O00268 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF4O00268 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF4O00268 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF4O00268 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF4O00268 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF4O00268 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms